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Livre

Principes de biologie moléculaire en biologie clinique

Résumé

Présente l'ensemble des techniques de biologie moléculaire mises en oeuvre en biologie clinique. Sont ainsi détaillés les outils de base et les méthodes issues de leur utilisation.


  • Autre(s) auteur(s)
  • Éditeur(s)
  • Date
    • 2005
  • Notes
    • Glossaire. Index
  • Langues
    • Français
  • Description matérielle
    • XIII-705 p. ; 27 x 21 cm
  • Collections
  • Sujet(s)
  • ISBN
    • 2-84299-685-2
  • Indice
  • Quatrième de couverture
    • Principes de biologie moléculaire en biologie clinique

      Depuis ses débuts, il y a 50 ans, la biologie moléculaire ne cesse de révolutionner le monde de la biologie par ses nombreuses découvertes. Les avancées de cette discipline et leurs multiples implications bouleversent notre vision de l'humain et du vivant et s'accompagnent de débats cruciaux sur le plan de l'éthique médicale et scientifique.

      À l'heure où le séquençage du génome humain est achevé avec succès, la PCR en temps réel, l'interférence ARN, la génomique, les puces d'expression, de diagnostic et de séquençage, la pharmacogénétique, la protéomique, s'imposent comme de nouveaux outils au service de la médecine et de la biologie.

      Ce livre présente le vaste panorama des techniques moléculaires disponibles, leur puissance d'analyse et la complexité des phénomènes étudiés. Novateur à plus d'un titre, Principes de biologie moléculaire en biologie clinique fait apparaître l'importance et le statut particulier que la biologie moléculaire tient actuellement dans la pratique de la médecine. En effet, il semble dorénavant difficile de n'y voir qu'un groupe de techniques, mais plutôt une spécialité au sein de la biologie médicale.

      Les auteurs exposent les procédés et les clés d'interprétation de manière transversale car les technologies moléculaires reposent sur les mêmes principes, quel que soit le domaine particulier de leur application dans la pratique médicale.

      Extrêmement pédagogique et clair, cet ouvrage s'adresse à un large public : étudiants en médecine, en pharmacie et en sciences de la vie, biologistes et cliniciens.


  • Tables des matières
      • Principes de biologie moléculaire en biologie clinique

      • Nedjma Ameziane, Marc Bogard, Jérôme Lamoril

      • Elsevier

      • PréfaceVII
      • Partie I. Bases fondamentales1
      • 1 Généralités3
      • Structure des acides nucléiques3
      • Code génétique5
      • Description générale du génome humain5
      • Réplication14
      • Du génotype au phénotype : l'expression d'un gène16
      • Annexe33
      • 2 Bases de pathologie moléculaire35
      • Génétique mendélienne35
      • Génétique non mendélienne41
      • Mutations mitochondriales43
      • Anomalies d'empreintes génomiques44
      • Polymorphismes45
      • Gènes de susceptibilité - Modulation polygénique des maladies monogéniques48
      • Gènes modificateurs49
      • Maladies polygéniques et multifactorielles49
      • Pathologie moléculaire : les mutations50
      • Généralités sur les effets des mutations63
      • Relation génotype-phénotype66
      • Mutation(s) et pathologie68
      • Mutation(s) et pathologie73
      • Nomenclature des variations de séquence73
      • Partie II. Les outils utilisés en biologie moléculaire81
      • 3 Enzymes de restriction-modification83
      • Enzymes de restriction84
      • Méthyltransférases99
      • Conclusion105
      • 4 Polymérases107
      • ADN polymérases107
      • ARN polymérases123
      • Transcriptases inverses125
      • Conclusion126
      • ADN polymérases et réparation de l'ADN126
      • 5 Enzymes de modification131
      • Nucléases131
      • Phosphatases alcalines137
      • Kinases138
      • Transférase terminale138
      • Enzymes intervenant dans la réparation de l'ADN138
      • Enzymes et produits divers150
      • Conclusion153
      • 6 Séparation des acides nucléiques155
      • Électrophorèse155
      • Méthodes de capture167
      • Conclusion170
      • 7 Synthèse des oligonucléotides173
      • Éléments constitutifs de la synthèse d'oligonucléotides173
      • Synthèse proprement dite174
      • Caractéristiques physicochimiques des oligonucléotides188
      • 8 Hybridation moléculaire195
      • Fusion de l'ADN195
      • Obtention et marquage des sondes199
      • Hybridation proprement dite209
      • Détection des hybrides marqués par des sondes210
      • Applications211
      • Conclusion211
      • 9 Extraction-purification de l'ADN et de l'ARN215
      • Recueil du spécimen216
      • Extraction des acides nucléiques216
      • Automatisation de l'extraction-purification225
      • Conclusion226
      • Partie III. Amplification génique229
      • 10 Polymerase chain reaction et autres systèmes d'amplification231
      • Limites de l'identification de séquences nucléiques par hybridation moléculaire231
      • Définition de l'amplification génique232
      • Amplification de cibles : la polymerase chain reaction 232
      • Amplification par PCR « classique »232
      • Amplification par PCR en temps réel251
      • PCR quantitative265
      • Techniques alternatives d'amplification 285
      • Amplification par processus transcriptionnel : TMA, NASBA et 3SR285
      • Amplification par déplacement de brin (SDA)287
      • Techniques d'amplification basées sur la rolling circle amplification289
      • Ligase chain reaction 290
      • Cycling probe reaction 292
      • ADN branché ou branched DNA (bDNA)293
      • Système Hybrid capture®294
      • Systèmes anticontamination 296
      • Méthodes physiques d'isolement297
      • Destruction de l'ADN contaminant avant introduction de la cible297
      • Modification des amplicons afin de les différencier de la cible298
      • Application des méthodes anticontaminations aux autres procédés d'amplification303
      • Mise en place d'un système de prévention des contaminations303
      • Partie IV. Principales techniques de détection des mutations309
      • 11 Techniques de criblage (screening) des mutations311
      • Électrophorèse en gradient de gel dénaturant311
      • Chromatographie liquide haute performance en milieu dénaturant314
      • Polymorphisme de conformation simple brin (single strand conformation polymorphism, SSCP)315
      • Analyse d'hétéroduplex (heteroduplex analysis, HA ou heteroduplex mobility assay, HMA)317
      • Transcription-traduction en protéine (protein transcription translation assay, PTT)318
      • Technique CFLPTM (Cleavase®fragment length polymorphism)320
      • Clivage chimique des mésappariements (chemical clivage mismatch, CCM)321
      • Technique d'empreinte par didéoxynucléotides (dideoxy-fingerprinting, ddF)322
      • Système BESS-T&GTM Base Readers (BESS MutaScanTM ; base excision sequence scanning, BESS)323
      • Étude de l'ARN après protection contre les RNAses, le système NIRCATM324
      • PCR multiplex325
      • Southern blot327
      • 12 Techniques de détection des mutations connues333
      • Techniques d'hybridation à l'aide d'oligonucléotides spécifiques d'allèle (allele specific oligonucleotides, ASO) : dot/slot-blot et reverse dot-blot333
      • Extension d'amorce ou miniséquençage335
      • PCR spécifique d'allèle336
      • Système de génotypage READITTM SNP338
      • Principe338
      • Digestion enzymatique (Southern blot et PCR-RFLP)339
      • Détection par acides nucléiques peptides (peptide nucleic acid, PNA)340
      • Technique de ligature des oligonucléotides (oligonucleotide ligation assay, OLA)341
      • Techniques de PCR en temps réel343
      • Détection par acides nucléiques verrouillés (locked nucleic acid, LNA)345
      • RCA (rolling circle amplification)346
      • Technique de clivage invasif : InvaderTM349
      • Techniques de génotypage à partir de pool d'ADN (pooling DNA)350
      • Technique de référence : le séquençage351
      • Multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA)351
      • Principe351
      • Avantages351
      • Inconvénients353
      • Applications353
      • Variante de MLPA354
      • Applications354
      • 13 Techniques de mise en évidence indirecte de mutations359
      • Analyse de microsatellites359
      • Longue PCR (long PCR)362
      • 14 Étude des modifications épigénétiques365
      • Introduction365
      • Techniques utilisées pour l'étude de la méthylation de l'ADN367
      • DHPLC371
      • 15 Autres techniques375
      • Spectrométrie de masse375
      • Puces à ADN379
      • Pyroséquençage387
      • Partie V. Le séquençage des acides nucléiques401
      • 16 Techniques de séquençage de l'ADN403
      • Méthode de Sanger403
      • Séquençage avec la méthode de Maxam et Gilbert410
      • Séquençage par hybridation ou sequencing by hybridization (SBH)410
      • Mini-séquençage luminométrique en temps réel ou pyrosequencing412
      • Autres méthodes de séquençage415
      • Partie VI. Les stratégies de détection des mutations417
      • 17 Approche générale419
      • Principes généraux419
      • Techniques d'analyse moléculaire de l'ADN423
      • Techniques d'analyse moléculaire de l'ARN424
      • Quantification des acides nucléiques425
      • Que choisir ?426
      • Droit et biologie moléculaire426
      • Partie VII. Principaux outils d'étude de la fonction des gènes431
      • 18 Principales méthodes d'exploration de la fonction des gènes433
      • Principes du sous-clonage433
      • Introduction aux vecteurs d'expression436
      • Transcription/traduction in vitro446
      • Mutagenèse in vitro448
      • Étude de la fonctionnalité des gènes par interférence d'ARN449
      • Retardement sur gel452
      • Empreinte ADN ou DNase I footprinting454
      • Protection de la ribonucléase454
      • Sensibilité aux nucléases S1457
      • Amplification rapide des extrémités d'ADNc457
      • Mesure de la demi-vie de l'ARNm458
      • Partie VIII. Le laboratoire de biologie moléculaire461
      • 19 Organisation d'un laboratoire de biologie moléculaire463
      • Problème des contaminations464
      • Maîtrise des risques de contamination465
      • Équipement du laboratoire467
      • Entretien et précaution469
      • Évolutions récentes et à venir470
      • Partie IX. Les domaines d'application en biologie moléculaire473
      • 20 Principales applications de la biologie moléculaire475
      • Considérations générales475
      • Recherche et analyse de génome étranger : la microbiologie476
      • Analyse du génome humain478
      • Diagnostic prénatal485
      • Diagnostic préimplantatoire489
      • Résultats du DPI492
      • Avantages et inconvénients du DPI494
      • Aspects juridiques en France494
      • Éthique générale en biologie moléculaire495
      • Annexe : la législation en France501
      • Partie X. Thérapie génique503
      • 21 Principes généraux de la thérapie génique505
      • Généralités sur la thérapie génique506
      • Méthodes de transferts de matériel génétique506
      • Applications de la thérapie génique527
      • Thérapie génique et réglementations532
      • Pharmacologie et traitement du gène532
      • Thérapie génique naturelle - Mutations inverses535
      • Partie XI. Nouvelles stratégies541
      • 22 Puces à ADN ou micro-array543
      • Puce à ADN ou micro-array543
      • Exemple de puces : GeneChip® Affymetrix552
      • Amélioration des techniques relatives aux puces et arrays558
      • Applications562
      • Conclusion570
      • 23 Protéomique573
      • Définition574
      • Analyse par protéomique574
      • Applications583
      • Informatique et protéomique585
      • Conclusion585
      • 24 ARN interférence589
      • Rappel sur l'inactivation des ARN messagers chez les mammifères589
      • Découverte du phénomène d'ARN interférence591
      • Mécanisme de l'ARN interférence591
      • ARN interférence et génome592
      • Intérêt de l'ARN interférence en génomique593
      • L'ARN interférence en pratique594
      • Applications603
      • Conclusion605
      • 25 Micro-ARN609
      • Origine et mécanisme des micro-ARN610
      • Localisation des gènes codant pour les miARN611
      • Fonction des micros ARN611
      • Analyse des miARN613
      • Conclusion616
      • Partie XII. Principes du clonage619
      • 26 Introduction à la transgenèse et au clonage621
      • Principes de transgenèse621
      • Techniques de transfert de gènes628
      • Expression des transgènes629
      • Introduction au clonage des mammifères par transfert de noyau dans des cellules somatiques630
      • La parthénogenèse, une alternative au clonage636
      • Annexe : les textes de loi en France639
      • Sites internet de biologie moléculaire641
      • 27 Sites internet643
      • 28 Rebase® http://rebase.neb.com/655
      • Rebase® : caractéristiques générales655
      • Le site Rebase®656
      • Conclusion670
      • Postface673
      • La biologie moléculaire, une nouvelle spécialité en biologie médicale ?675
      • Doit-on changer la formation du biologiste en biologie moléculaire ?676
      • Étude du génome humain et des génomes étrangers en médecine humaine676
      • Propositions pour la génétique moléculaire676
      • Biologie moléculaire et société677
      • Glossaire679
      • Index699

  • Origine de la notice:
    • Electre
  • Disponible - 577.5 AME

    Niveau 2 - Sciences