Les maladies émergentes
Épidémiologie chez le végétal, l'animal et l'homme
Éditions Quae
Remerciements
1
Préface
3
Avant-propos
5
Jacques Barnouin et Ivan Sache
Première partie. Facettes et complexité de l'émergence
1. L'émergence épidémiologique : concepts, perspectives scientifiques
et sociétales
9
Jacques Barnouin
2. Les maladies émergentes affectant les végétaux
21
Ivan Sache
3. Les maladies émergentes chez l'animal
31
Gwenaël Vourc'h
4. Les maladies émergentes chez l'homme : le SRAS et la grippe aviaire
39
Arnaud Fontanet
5. Invasions biologiques et émergences de maladies
43
Marie-Laure Desprez-Loustau
Références bibliographiques
49
Deuxième partie. Détection et analyse biologiques des émergences
6. Détection et analyse en temps réel des maladies animales
émergentes
59
Jacques Barnouin, Gwenaël Vourc'h, Jocelyn de Goer, Nelly Dorr
7. L'observatoire national des anomalies bovines : objectifs, actions
et premiers résultats
69
Alain Ducos, Luc Manciaux, Amandine Duchesne, Alain Malafosse,
André Eggen
8. Pour un système d'information sur les troubles respiratoires des veaux
en troupeaux de bovins à viande
75
Henri Seegers, Sébastien Assié, François Beaudeau, Nathalie Bareille
9. Actualités des méthodes d'analyses sans a priori pour l'étude
des émergences
83
Jean-Jacques Godon, Patrick Dabert, Nathalie Wéry, Valérie Bru-Adan,
Jean-Philippe Delgenès
10. Méthodes innovantes pour la détection de champignons pathogènes
forestiers émergents
89
Marie-Laure Desprez-Loustau, Cécile Robin, Marc Buée,
Olivier Fabreguettes, Claude Husson, Brigitte Lung-Escarmant, Annie Yart,
Jean-Jacques Godon
Références bibliographiques
97
Troisième partie. Détection statistique et modélisation
de la dynamique des émergences
11. Méthodes statistiques de détection d'anomalies spatio-temporelles
en épidémiologie
105
Rachid Senoussi, Émilie Gay, Christine Jacob
12. Modélisation statistique des événements rares : le cas des valeurs
extrêmes et de l'étude des émergences
111
Myriam Charras-Garrido, Zaher Khraibani, Christine Jacob,
Christian Ducrot
13. Détection d'émergences localisées au sein d'une maladie endémique
123
Émilie Gay, Jacques Barnouin, Rachid Senoussi
14. Analyse des phases précoces d'une épidémie affectant les organes
aériens des plantes : application aux rouilles du blé
129
Samuel Soubeyrand, Ivan Sache
15. Rôle de la géométrie du réseau d'interaction dans l'émergence
d'une maladie
139
Alain Franc, Nathalie Peyrard
16. Le potentiel épidémique d'une maladie émergente
145
Pierre-Yves Boëlle
17. L'émergence dans les systèmes artificiels pour la compréhension
des phénomènes naturels
153
Pierre Glize, Jean-Pierre Georgé, Jean-Pierre Mano
18. Épidémiologie et surveillance de la fièvre de la vallée du Rift
dans un contexte de changements globaux
163
Véronique Chevalier, Stéphane de La Rocque, Renaud Lancelot
19. Dynamique spatiale et temporelle de l'émergence du virus
de l'influenza aviaire hautement pathogène : l'exemple des vagues
épizootiques en Thaïlande
173
Marc Souris, Jean-Paul Gonzalez
Références bibliographiques
191
Quatrième partie. Facteurs environnementaux des émergences
20. Mouches des fruits invasives : l'exemple du genre Bactrocera
201
Serge Quilici, Pierre-François Duyck
21. Le dépérissement bactérien des Alliacées : émergence
d'une phytobactériose
211
Philippe Roumagnac, Isabelle Robène-Soustrade, Laurence Humeau,
Lionel Gagnevin, Frédéric Chiroleu, Éric Jeuffrault, Olivier Pruvost
22. Étude intégrée du développement d'une maladie réémergente
transmise par vecteur
221
Gaël Thébaud, Joël Chadoeuf, Gérard Labonne
23. Oiseaux sauvages et émergence : le virus West Nile en zone
méditerranéenne
229
Elsa Jourdain, Michel Gauthier-Clerc, Hervé G. Zeller, Philippe Sabatier
24. L'émergence de la fièvre catarrhale ovine en France : approche
interdisciplinaire du compartiment «vecteurs»
239
Fabienne Coroller, Hélène Guis, Bruno Mathieu, Annelise Tran,
Jean-Claude Delécolle, Thierry Baldet, François Roger
25. Évaluation de la survie de la flore fécale porcine au travers des filières
de gestion des lisiers
249
Patrick Dabert, Anne-Marie Pourcher, Pascal Peu, Hubert Brugère,
Jean-Jacques Godon
26. Effluents d'abattoir et appréciation du risque d'émergence
de bactéries pathogènes
261
Estelle Loukiadis, Monique Kérourédan, Éric Oswald, Hubert Brugère
Références bibliographiques
271
Cinquième partie. Barrière d'espèces et émergences virales
27. L'émergence de maladies virales chez les plantes : des situations
variées et des causes multiples
281
Hervé Lecoq, Cécile Desbiez, Frédéric Fabre, Mireille Jacquemond,
Benoît Moury, Éric Verdin
28. La barrière d'espèces et les virus
291
Baya Amel Bouzar, Esadk Ali Erhouma, Théodore Alogninouwa,
Jitka Durand, Laila Mselli-Lakhal, François Guiguen, Yahia Chebloune
29. Infection naturelle du bouquetin par un lentivirus de type CAEV
301
Esadk Ali Erhouma, François Guiguen, Timothy Greenland,
Laila Mselli-Lakhal, Baya Amel Bouzar, Jitka Durand,
Dominique Gauthier, Jean-François Mornex, Yahia Chebloune,
Théodore Alogninouwa
30. Cancers rétroviraux : construction d'une enquête d'exposition
aux petits ruminants
311
Geneviève Cordier, Philippe Vanhems, Delphine Magnin, Jacques Cadranel,
Caroline Leroux, Vincent Cottin, Jean-François Mornex
31. Infection par le virus de l'hépatite E chez les humains et les animaux
en France
317
Antoine Touzé, Marc Grandadam, Michel Pascal, Jean-Louis Bind,
Jacqueline Bour, Pascal Boireau, Yves Buisson, Pierre Coursaget
Références bibliographiques
325
Sixième partie. Politiques de santé face aux émergences
32. L'OEPP et les maladies végétales émergentes
335
Anne-Sophie Roy
33. La politique biosécuritaire australienne et son application
aux bioagresseurs émergents des végétaux
343
Peter Whittle et Andy Sheppard
34. L'OIE et les maladies animales émergentes
363
Karim Ben Jebara
35. Émergences épidémiologiques non conventionnelles
et analyse de risque : biosécurité agricole et agroterrorisme
373
Frédéric Suffert
36. La politique sanitaire du Royaume-Uni face aux menaces
des maladies animales émergentes
385
Ruth Lysons, Jane Gibbens, Liz Kelly, Giles Paiba
37. Anticipation, détection et investigation des phénomènes infectieux
émergents chez l'homme
391
Dounia Bitar, Didier Che, Isabelle Capek, Jean-Claude Desenclos
38. Nutrition humaine et émergence : l'exemple de l'obésité
403
Emmanuelle Kesse-Guyot, Sandrine Bertrais, Sébastien Czernichow,
Marie-Françoise Rolland-Cachera, Serge Hercberg
39. Un regard sociologique sur la biopolitique des maladies émergentes
et réémergentes
411
Marc Barbier, Giovanni Prete
Références bibliographiques
423
Conclusion : les idées-forces sur la question des maladies émergentes
429
Jacques Barnouin, Marie-Laure Desprez-Loustau, Jean-Jacques Godon,
Christine Jacob, Gérard Labonne, Philippe Sabatier, Gwenaël Vourc'h,
Ivan Sache
Liste des auteurs
435