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Livre

Guide pour la constitution d'une biobanque associée aux études épidémiologiques en population générale

Résumé

Le point sur les principaux aspects de la constitution d'une biobanque et sur son fonctionnement, associée à des études en population générale. Sont rassemblées ici des recommandations reflétant l'état de l'art en matière d'ingénierie de biobanques pour les médecins et les chercheurs impliqués dans la collecte des ressources biologiques.


  • Contributeur(s)
  • Éditeur(s)
  • Date
    • impr. 2012
  • Notes
    • Bibliogr. p. 99-104. Webliogr. p. 105
  • Langues
    • Français
  • Description matérielle
    • 1 vol. (XIV-120 p.) : couv. ill. en coul. ; 24 cm
  • Sujet(s)
  • ISBN
    • 978-2-7430-1448-3
  • Indice
    • 614 Santé publique, médecine hospitalière, médecine préventive
  • Quatrième de couverture
    • Les grandes études en population s'accompagnent de plus en plus souvent de la constitution d'une biobanque, associant aux données cliniques, biologiques, environnementales et comportementales collectées la conservation d'échantillons biologiques. Les biobanques sont ainsi un élément indispensable des dispositifs d'information sur l'état de santé lié aux phénotypes, aux génotypes et aux facteurs d'environnement.

      La conservation des informations recueillies devient alors indispensable, permettant de disposer de données déjà collectées pour apporter une réponse rapide lorsque surgit une nouvelle question de santé publique ou pour mesurer les paramètres biologiques à l'aide de méthodes plus performantes qu'au moment du recueil des informations ou selon de nouveaux de paramètres.

      L'objectif de ce livre est de faire le point sur les principaux aspects de la constitution, du fonctionnement et de l'utilisation de biobanques associées à des études en population générale et d'apporter une aide pour l'établissement du cahier des charges d'une biobanque.

      L'ouvrage comporte :

      • des recommandations générales qui reflètent l'état de l'art en matière d'ingénierie de biobanques ;
      • des éléments relatifs aux principaux choix stratégiques concernant la structure chargée de la conservation des échantillons biologiques et les options techniques pouvant être retenues pour le traitement et la conservation des échantillons ;
      • une présentation de l'infrastructure nationale Biobanques, qui coordonne l'ensemble des biobanques en France et assure le lien avec les structures scientifiques équivalentes à l'échelle européenne et internationale.

      L'ouvrage s'adresse aux médecins, biologistes et chercheurs impliqués dans la collecte et l'exploitation des ressources biologiques.


  • Tables des matières
      • Guide pour la constitution d'une biobanque associée aux études épidémiologiques en population générale

      • Joseph Henny

      • Lavoisier

      • Préface XI
      • Pourquoi ce document ? XIII
      • L'ingénierie de la biobanque
      • 1. Objectifs et solutions techniques pour une biobanque associée à une étude en population 3
      • Objectifs d'une biobanque3
      • Objectifs scientifiques5
      • Objectifs opérationnels et techniques5
      • Méthode de travail pour la préparation de ce document6
      • 2. Analyse des fonctions et recommandations de solutions techniques pour une biobanque 9
      • Prélèvements et recueil d'échantillons biologiques9
      • Prélèvement sanguin 10
      • Recueil urinaire 13
      • Recueil salivaire 13
      • Recueil des selles 13
      • Autres matériaux biologiques 14
      • Cas particuliers de composés labiles 14
      • Identification des prélèvements 14
      • Transport15
      • Périodicité 15
      • Réception des échantillons15
      • Aliquotage16
      • Cryotubes 16
      • Paillettes haute sécurité 17
      • Identification des aliquots18
      • Numéro d'identification 18
      • Équipements nécessaires (cas particulier de l'aliquotage manuel) 19
      • Systèmes d'identification du futur : radio-identification 19
      • Stockage : conservation des échantillons biologiques20
      • Froid mécanique 21
      • Azote liquide 23
      • Modes de rangement24
      • Retrait d'échantillons25
      • Recherche d'échantillons 26
      • Récupération d'échantillons 26
      • Expédition des échantillons aux laboratoires utilisateurs27
      • Sécurité biologique 27
      • Règles de transport 27
      • Modalités de transport 27
      • Étiquetage 28
      • Fonctions support28
      • Système informatisé de gestion des stocks 28
      • Politique de qualité31
      • Assurance qualité 31
      • Maintenance 32
      • Élimination des déchets 33
      • Management de la biobanque33
      • Ressources humaines 33
      • Modèle économique 34
      • Accès aux matériaux biologiques conservés 34
      • Gouvernance de la biobanque34
      • Aspects organisationnels 35
      • Aspects juridiques 36
      • Propriété des échantillons biologiques 36
      • Règles de fonctionnement 36
      • Accès aux matériaux biologiques conservés 37
      • Infrastructures37
      • Descriptif des postes de travail 38
      • Descriptif des installations de stockage 39
      • Administration 41
      • Sécurité 42
      • Biobanque miroir42
      • Analyse critique 42
      • Conclusion 43
      • Certification43
      • Biosécurité44
      • Propositions de stratégies
      • 3. Options techniques pour le traitement des échantillons 47
      • Problèmes généraux47
      • Traitement centralisé versus traitement délocalisé sur sites de prélèvement de la «phase préconservation» 47
      • Les grands choix49
      • Scénario 1 : aliquotage délocalisé manuel en cryotubes50
      • Principe 50
      • Ressources humaines 51
      • Locaux 52
      • Étude critique 52
      • Conclusion 53
      • Scénario 2 : aliquotage centralisé robotisé en cryotubes54
      • Principe 54
      • Variante : utilisation d'un trieur de tubes (tube sorter)55
      • Ressources humaines 55
      • Locaux 56
      • Étude critique 56
      • Conclusion 58
      • Scénario 3 : aliquotage, stockage et retrait d'échantillons robotisés59
      • Principe 59
      • Ressources humaines 60
      • Locaux 60
      • Étude critique 60
      • Conclusion 62
      • Scénario 4 : aliquotage centralisé robotisé en paillettes63
      • Principe 63
      • Ressources humaines 64
      • Locaux 65
      • Étude critique 65
      • Conclusion 66
      • Options67
      • Option n° 1 : aliquotage centralisé robotisé en cryotubes ; robotisation partielle du retrait des aliquots (compatible avec le scénario n° 2) 67
      • Option n° 2 : conservation partielle en cryotubes et en vapeur d'azote liquide (compatible avec les scénarii n° 2 et n° 3, voire n° 4) 68
      • Option n° 3 : cas particulier de la conservation des acides nucléiques (ADN) 69
      • Option n° 4 : démultiplication du nombre des aliquots (compatible avec les scénarii n° 2 et n° 3) 74
      • Option n° 5 : aliquotage robotisé sur chaque site de prélèvement (compatible avec les scénarii n° 2 et n° 3, possible avec limites avec le scénario n° 4) 74
      • 4. Choix de la structure chargée de la conservation des échantillons 77
      • Stratégie interne77
      • Principe 77
      • Étude critique 78
      • Conclusion 78
      • Stratégie externe78
      • Principe 78
      • Étude critique 80
      • Conclusion 80
      • 5. Création et valorisation d'une biobanque 81
      • Chronologie simplifiée des opérations pour la création d'une biobanque associée à une étude en population81
      • Valorisation de la biobanque82
      • Biobanque associée à une étude épidémiologique 82
      • Mutualisation de biobanques 83
      • Encadré : limites de ce document 85
      • Concernant les orientations85
      • Concernant les solutions techniques présentées85
      • Concernant la faisabilité des différentes solutions85
      • Concernant la gestion des données85
      • Concernant le traitement préanalytique (ou préconservation)86
      • Concernant les ressources humaines86
      • Concernant l'utilisation de spécimens biologiques par les laboratoires demandeurs86
      • Concernant le plan de financement86
      • 6. L'infrastructure nationale Biobanques 87
      • Objectifs stratégiques de biobanques88
      • Structuration de biobanques88
      • Coordination, dissémination et formation 88
      • Qualité et biosécurité 89
      • Plate-forme réglementaire, éthique et sociétale 90
      • Méthodologie et outils statistiques 90
      • Bioinformatique et interopérabilité des bases de données 91
      • Développement technologique 91
      • Partenariats public-privés 92
      • Conclusion générale 95
      • Références bibliographiques 99
      • Documents généraux : recommandations d'organismes officiels ou professionnels99
      • Publications scientifiques100
      • Annexes 107
      • Annexe 1 : exemple de cahier des charges pour la pré-étude d'une biobanque (résumé)109
      • Annexe 2 : analyse financière des différents scénarii proposés112
      • Annexe 3 : fiche de renseignement à compléter par les équipes de recherche utilisatrices d'échantillons115
      • Annexe 4 : monitorage des prélèvements (exemple)116
      • Annexe 5 : critères de décision pour les choix à effectuer117
      • Annexe 6 : fournisseurs potentiels contactés. Remerciements120

  • Origine de la notice:
    • FR-751131015
  • Disponible - 614 HEN

    Niveau 3 - Médecine