Ecologie chimique

Résumé

Synthèse sur l'éventail des recherches initiées en écologie chimique. Cette discipline analyse la médiation chimique et impalpable entre les organismes vivants leur permettant de communiquer entre eux, dans leur environnement. Elle couvre une grande diversité de milieux, des tropiques aux régions polaires, d'écosystèmes et d'organismes. ©Electre 2017

Contributeur(s)
Éditeur(s)
- Iste éditions
Date
- 2017
Notes
- Glossaire. Index
Langues
- Français
Description matérielle
- 1 vol. (239 p.) : illustrations en noir et en couleur ; 24 x 16 cm
Collections
- Ecologie
Sujet(s)
- Écologie chimique
ISBN
- 978-1-78405-186-0
Indice
- 577.4 Biochimie
Quatrième de couverture
- Ecologie chimique offre une vision holistique des nouveaux champs de recherche de cette discipline à travers une grande diversité d'approches. Il traite de systèmes complexes dans un monde changeant à travers un grand nombre d'organismes modèles en passant des micro-organismes aux mammifères incluant l'homme. Il couvre une grande diversité de milieux allant des tropiques aux régions polaires et décrypte le rôle de la médiation chimique qui permet aux organismes vivants de communiquer entre individus de la même espèce ou entre espèces différentes, et avec leur environnement.
  Dans un contexte de changements globaux où le maintien de la biodiversité représente un véritable défi, cet ouvrage permet de comprendre la structure et le fonctionnement des écosystèmes.
  Les chercheurs qui ont contribué à cet ouvrage - biologistes, écologistes, biochimistes, chimistes, biostatisticiens - observent les milieux terrestres, aquatiques, marins et d'eau douce.
Tables des matières
- - Ecologie chimique
  - Anne-Geneviève Bagnères
  - Martine Hossaert-Mckey
  - iSTE
  - Préface15
  - Stéphanie Thiébault et Françoise Gaill
  - Introduction17
  - Anne-Geneviève Bagnères et Martime Hossaert-Mckey
  - Chapitre 1. Biodiversité et médiation chimique21
  - Bertrand Schatz, Doyle McKey et Thierry Pérez
  - 1.1. Systématique et taxonomie intégrative grâce à l'écologie chimique21
  - 1.2. Communiquer par les odeurs entre partenaires sexuels24
  - 1.3. Communiquer par les odeurs entre espèces26
  - 1.4. Le mimétisme chimique, pour mieux se reproduire27
  - 1.5. Un dialogue évolue parfois en un réseau d'interactions29
  - 1.6. Conclusion36
  - 1.7. Bibliographie37
  - Chapitre 2. Ecologie chimique : une science intégrative et expérimentale41
  - Anne-Marie Cortesero, Magali Proffit, Christophe Duplais et Frédérique Viard
  - 2.1. Les médiateurs chimiques41
  - 2.2. Ecologie chimique dans les réseaux multitrophiques et la coévaluation entre espèces46
  - 2.3. Contribution de l'écologie chimique à l'étude de l'adaptation des plantes tropicales50
  - 2.4. Quand l'écologie chimique nous éclaire sur les processus d'invasions biologiques : un exemple démonstratif d'intégration entre chimie et écologie54
  - 2.5. Une protection dans l'air : comment les plantes se défendent des attaques des insectes phytophages à travers l'émission de composés volatils58
  - 2.6. Conclusion61
  - 2.7. Bibliographie61
  - Chapitre 3. Les odeurs dans la vie sociale des primates65
  - Marie Charpentier, Guillaume Odonne et Benoist Schaal
  - 3.1. Les sociétés de primates et leurs systèmes de communication complexes65
  - 3.2. La place des odeurs dans les communications humaines71
  - 3.2.1. Les odeurs humaines transmettent une variété d'indices odorants71
  - 3.2.2. Corrélats odorants des états internes73
  - 3.2.3. Quelles fonctions pour les odeurs sociales dans la vie quotidienne ?74
  - 3.2.4. Les phéromones humaines, une fiction ?77
  - 3.3. L'olfaction et la gustation dans la quête des aliments et des remèdes78
  - 3.3.1. Le sens et les interactions avec l'alimentation chez les primates79
  - 3.3.2. Le sens et l'automédication chez les animaux80
  - 3.3.3. Les sens dans les thérapeutiques humaines82
  - 3.3.4. Une vision évolutionniste du lien entre sensation et santé82
  - 3.4. Conclusion : les fonctions adaptatives de l'olfaction chez des espèces dites « microsmatiques »84
  - 3.5. Bibliographie85
  - Chapitre 4. Microbiome et écologie chimique89
  - Soizic Prado, Catherine Leblanc et Sylvie Rebuffat
  - 4.1. Les micro-organismes protagonistes de l'écologie chimique89
  - 4.2. Les stratégies d'étude du microbiome90
  - 4.2.1. Comment caractériser le microbiome ?90
  - 4.2.2. Quels sont les outils disponibles qui permettent de comprendre les rôles du microbienne ?91
  - 4.3. Le dialogue moléculaire des micro-organismes93
  - 4.3.1. Langage et vie sociale des micro-organismes93
  - 4.3.2. Les peptides antimicrobiens, des acteurs clés de l'équilibre des communautés bactériennes96
  - 4.3.3. Champignons et bactéries communiquent pour mieux s'entraider97
  - 4.3.4. Quand l'entraide dégénère : guerre chimique entre bactéries et champignons97
  - 4.3.5. Les champignons Trichoderma : une artillerie lourde contre les champignons pathogènes98
  - 4.4. Communication chimique entre les micro-organismes et leurs hôtes99
  - 4.4.1. Les relations plantes-bactéries : des interactions essentielles aux différents partenaires99
  - 4.4.1.1. Relation symbiotique dans la rhizosphère entre légumineuses et bactéries Rhizobium99
  - 4.4.1.2. La symbiose actinorhizienne, une autre relation symbiotique de la rhizosphère100
  - 4.4.2. Les plantes établissent aussi des relations intimes avec les champignons101
  - 4.4.2.1. La symbiose mycorhizienne : un autre modèle d'interaction chimique bénéfique et essentiel au sein de la rhizosphère101
  - 4.4.2.2. L'aide précieuse des champignons endophytes102
  - 4.4.2.3. Quand les champignons deviennent de véritables ennemis pour les plantes102
  - 4.4.3. Des antinobactéries mutualistes prodiguent leurs soins aux insectes103
  - 4.4.4. Communication chimique entre micro-organismes et hôte dans le monde marin105
  - 4.4.4.1. Décryptage d'une interaction chimique bénéfique entre algues et bactéries105
  - 4.4.4.2. Un langage chimique dense et complexe entre invertébrés marins et leurs bactéries associées106
  - 4.5. Régulations et évolutions des interactions dans les écosystèmes et environnements changeants107
  - 4.5.1. Apport de l'écologie chimique à la connaissance des mécanismes de biosynthèses des médiateurs chimiques107
  - 4.5.2. Les réseaux métaboliques, de nouveaux outils pour étudier l'évolution des interactions hôte/microbiome108
  - 4.6. Conclusions : de l'écologie chimique aux applications de demain, impacts de l'étude du microbiome109
  - 4.7. Bibliographie110
  - Chapitre 5. De l'écologie chimique à l'écogéochimie
    Catherine Fernandez, Virginie Baldy et Nadine Le Bris113
  - 5.1. Balance entre métabolisme primaire et métabolisme secondaire114
  - 5.2. Rôle des métabolites secondaires dans les interactions biotiques et la structuration des communautés117
  - 5.3. Métabolites secondaires et fonctionnement des écosystèmes : relation sol plante - brown food chain121
  - 5.4. Intégration des dynamiques biotiques et abiotiques : microhabitats marins benthiques127
  - 5.5. Conclusion132
  - 5.6. Bibliographie132
  - Chapitre 6. Les « omiques » en écologie chimique
    Sylvie Baudino, Christophe Lucas et Carole Smadja135
  - 6.1. Introduction : les différentes technologies « omiques »136
  - 6.2. Des « omiques » aux signaux : identifier de nouvelles molécules actives138
  - 6.3. Des « omiques » à l'écologie des communautés : identifier les interactions chimiques des organismes dans leurs milieux139
  - 6.4. Des « omiques » aux bases moléculaires : révéler les bases génétiques et moléculaires des interactions chimiques140
  - 6.5. Des « omiques » à la physiologie : caractériser les modes de production et de réception des molécules actives145
  - 6.6. Des « omiques » au rôle de l'environnement : comprendre l'impact de facteurs biotiques et abiotiques sur les interactions146
  - 6.7. Des « omiques » à l'évolution : comprendre et prédire la valeur adaptative des interactions chimiques148
  - 6.8. Conclusion151
  - 6.9. Bibliographie151
  - Chapitre 7. Apports de la métabolomique à l'écologie chimique
    Philippe Potin, Florence Nicolè et Olivier P. Thomas157
  - 7.1. Définition de la métabolomique157
  - 7.2. Les différentes stratégies des approches métabolomiques158
  - 7.3. Les différentes étapes pour la réalisation d'une étude métabolomique159
  - 7.3.1. Le design expérimental et l'échantillonnage160
  - 7.3.2. Les approches analytiques162
  - 7.3.3. Le traitement de données162
  - 7.3.3.1. Pre-processing : traitement des données brutes162
  - 7.3.3.2. Post-processing : traitement statistique des matrices finalisées163
  - 7.3.3.3. Identification des métabolites167
  - 7.3.3.4. Intégration des données dans les réseaux métaboliques et biologie des systèmes169
  - 7.4. Les applications de la métabolomique169
  - 7.4.1. Biodiversité chimique et chimiotaxonomie169
  - 7.4.2. Etude de la régulation et évolution des voies métaboliques / voies de biosynthèse170
  - 7.4.3. Apports à l'écologie fonctionnelle173
  - 7.4.4. Application de la métabolomique à l'étude des perturbations environnementales174
  - 7.5. Conclusion175
  - 7.6. Bibliographie176
  - Chapitre 8. Outils chimiques, bio-informatiques et bases de données en écologie chimique
    Nicolas Barthès, Jean-Claude Caissard, Jérémy Just et Xavier Fernandez179
  - 8.1. Outils chimiques179
  - 8.1.1. Outils analytiques de chromatographie179
  - 8.1.1.1. Prélèvements des composés volatils180
  - 8.1.1.2. Techniques séparatives des composés volatils181
  - 8.1.1.3. Détection des composés volatils184
  - 8.1.1.4. Séparation et détection des composés thermolabiles peu ou pas volatils184
  - 8.1.2. Approche analytique par résonance magnétique nucléaire186
  - 8.1.3. Techniques d'imagerie des métabolites secondaires188
  - 8.1.3.1. Techniques d'imagerie basées sur la spectrométrie de masse188
  - 8.1.3.2. Techniques d'imagerie basées sur les propriétés des photons189
  - 8.1.3.3. Autres techniques d'imagerie190
  - 8.2. Outils de séquençage191
  - 8.2.1. Principes, forces et limitations des NGS192
  - 8.2.1.1. Les grandes techniques de NGS192
  - 8.2.1.2. L'analyse des données de séquençage : la bio-informatique193
  - 8.2.2. Grands domaines d'application des NGS193
  - 8.2.2.1. Le séquençage des génomes193
  - 8.2.2.2. L'analyse de l'expression des gènes et des ARN non codants195
  - 8.2.2.3. L'imagerie dynamique des génomes196
  - 8.2.2.4. L'étude des communautés196
  - 8.3. Bases de données : la biodiversité in silico197
  - 8.3.1. Bases de données de composés chimiques et en écologie générale198
  - 8.3.2. Banques de données pour les « omiques » pouvant servir en écologie chimique199
  - 8.4. Conclusion200
  - 8.5. Annexe : les différentes bases de données internationales200
  - 8.6. Bibliographie201
  - Chapitre 9. Chimie pour le vivant éco-inspirée
    Bernard Banaigs, Ali Al Mourabit, Guillaume Clavé et Claude Grison205
  - 9.1. La nature comme modèle205
  - 9.2. La nature comme modèle pour le développement de nouvelles molécules d'intérêt207
  - 9.2.1. Des médiateurs chimiques aux nouveaux archétypes structuraux bioactifs208
  - 9.2.1.1. Les peptides lasso208
  - 9.2.1.2. Les peptaïbols209
  - 9.2.1.3. Les lipopetides210
  - 9.2.1.4. Les molécules du quorum sensing et du quorum quenching211
  - 9.2.1.5. Les mycosporine-like amino acides (MAAs)211
  - 9.2.2. Biosynthèses et synthèses biomimétiques212
  - 9.2.3. Médiateurs chimiques et interactions ligands/récepteurs : vers la découverte de nouveaux récepteurs cellulaires et d'outils biochimiques215
  - 9.3. Ecologie chimique et développement durable216
  - 9.3.1. Biocontrôle217
  - 9.3.2. Chimie bio-inspirée et phytotechnologies remédiatrices220
  - 9.3.2.1. Exemple de réduction biomimétique221
  - 9.3.2.2. Exemple d'oxydation biomimétique223
  - 9.4. Conclusion224
  - 9.5. Bibliographie225
  - Conclusion. Prospectives, ou l'écologie chimique de demain
    Martine Hossaert-McKey et Anne-Geneviève Bagnères227
  - Glossaire233
  - Index237
Origine de la notice:
- Electre