Biotope ; Muséum national d'histoire naturelle
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Disponible - 554.6(44) ATL
Niveau 2 - Sciences
Atlas français des bactéries du sol
Résumé
Cet atlas recense les communautés bactériennes présentes dans les sols de France, dont l'importance est cruciale pour leur qualité et leur fertilité, à partir des dernières techniques de pointe de séquençage d'ADN. Graphiques, cartes et tableaux présentent leurs caractéristiques ainsi que leur distribution géographique. ©Electre 2019
- Contributeur(s)
- Éditeur(s)
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Date
- 2018
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Notes
- Glossaire. Bibliogr.
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Langues
- Français
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Description matérielle
- 1 vol. (191 p.) : illustrations en noir et en couleur, cartes ; 31 x 22 cm
- Sujet(s)
- Lieu
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ISBN
- 978-2-36662-219-5
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Indice
- 554.6 Pédologie
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Quatrième de couverture
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Les sols abritent des communautés vivantes qui dépassent nos capacités de perception, par leur taille microscopique, mais aussi par leur incroyable foisonnement : un seul gramme de sol peut contenir plusieurs milliards de bactéries et plusieurs millions de champignons ! Dans ce même gramme de sol, on peut distinguer entre 100 000 et un million d'espèces de bactéries... Rien dans notre environnement quotidien, si ce n'est un ciel étoilé, ne nous prépare à une pareille abondance et une telle diversité.
Les chercheurs spécialistes de l'écologie microbienne de l'unité mixte de recherche « Agroécologie », rattachée à l'INRA Bourgogne-Franche-Comté, ont réalisé un inventaire des communautés bactériennes des sols de France. Basé sur les techniques les plus en pointe de séquençage d'ADN, ce travail a débouché sur la réalisation de cet atlas qui nous offre un panorama de ces communautés bactériennes, nous sensibilisant à leur importance dans la qualité et la fertilité des sols.
Un ouvrage unique tant par le sujet traité, que par des représentations originales qui nous permettent d'appréhender le monde bactérien des sols.
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Tables des matières
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- Remerciements8
- Les auteurs9
- Partenaires du programme de recherche10
- Avant-propos13
- Introduction14
- Préface18
- Généralités21
- Les communautés microbiennes du sol : de quoi prle-t-on ? 22
- L'arbre de la vie : position des bactéries et des archées22
- La taxomie22
- Intérêts des bactéries du sol pour la qualité de l'environnement24
- Les bactéries, source de fertilité du sol et soutien de la production végétale24
- Rôle des bactéries dans l'état sanitaire25
- Les bactéries, actrices du stockage et du recyclage du carbone28
- Dépollution et bioremédiation28
- Le sol : de quoi parle-t-on ? 31
- Qu'est-ce qu'un sol ?31
- Le sol : un habitat pour les micro-organismes32
- Méthodologie de l'Atlas35
- Échantillonnage des sols et mesures des paramètres de l'environnement 36
- Réseau de Mesure de la Qualité des Sols (RMQS)36
- Variabilité environnementale à l'échelle du RMQS37
- Conservation des sols40
- Conservatoire des sols : le laboratoire Infosol40
- Conservatoire des ressources génétiques microbiennes des sols : la plateforme Genosol40
- Caractérisation des communautés microbiennes 42
- Les nouveaux outils de microbiologie moléculaire42
- Les paramètres microbiens mesurés42
- La biomasse moléculaire microbienne42
- La diversité taxonomique bactérienne42
- La composition taxonomique des communautés44
- Les analyses statistiques 47
- Analyses multivariées47
- Géostatistiques47
- Partition de variance48
- Réseau d'interactions biotiques : les réseaux de co-occurrence48
- Méthodologie de la caractérisation des habitats microbiens en France49
- Portfolio53
- Cartographie et déterminisme des communautés microbiennes à l'échelle de la France63
- Guide de la lecture des fiches « Communautés » 64
- Fiches « Communautés » 66
- Biomasse moléculaire microbienne66
- Diversité bactérienne68
- Structure de la communauté bactérienne70
- Réseau d'interactions bactérien72
- Cartographie et déterminisme des phyla bactériens de France75
- Combien de phyla bactériens dans les sols français ? 76
- Occurrence et abondance des différents phyla bactériens dans les sols français 77
- Guide de lecture des fiches « Phylum » 80
- Fiches « Phylum » 82
- 01. Bacteroidetes82
- 02. Alphaproteobacteria84
- 03. Actinobacteria86
- 04. Planctomycetes88
- 05. Firmicutes90
- 06. Gammaproteobacteria92
- 07. Acidobacteria94
- 08. Betaproteobacteria96
- 09. Deltaproteobacteria98
- 10. Thaumarchaeota100
- 11. Crenarchaeota102
- 12. Chloroflexi104
- 13. Gemmatimonadetes106
- 14. Verrucomicrobia108
- 15. Nitrospirae110
- 16. Chlorobi112
- 17. Armatimonadetes114
- 18. Elusimicrobia116
- 19. Fibrobacteres118
- 20. Cyanobacteria120
- 21. TM6122
- 22. Deinococcus Thermus122
- 23. Synergistetes122
- 24. Epsilonproteobacteria123
- 25. Tenericutes123
- 26. Dictyoglomi123
- 27. Nitrospinae124
- 28. Euryarchaeota124
- 29. Thermodesulfobacteria124
- 30. Spirochaetes125
- 31. Chlamydiae125
- 32. Thermotogae125
- 33. Deferribacteres126
- 34. Fusobacteria126
- 35. Lentisphaerae126
- Synthèse des fiches « Phylum » 128
- Cartographie et déterminisme des habitats bactériens de France131
- Définition des habitats bactériens en France 132
- Cartographie des habitats bactériens à l'échelle de la France 133
- Guide de lecture des fiches « Habitat » 134
- Fiches « Habitat » 138
- 01. Sols très acides de prairies et de cultures138
- 02. Sols très acides de forêts de feuillus et de milieux peu anthropisés140
- 03. Sols très acides et sableux de forêts142
- 04. Sols très acides de forêts des Landes144
- 05. Sols très acides de forêts de feuillus et de milieux peu anthropisés146
- 06. Sols acides de prairies148
- 07. Sols acides de plaines cultivées150
- 08. Sols légèrement acides et pauvres en carbone de plaines cultivées152
- 09. Sols légèrement acides et riches en carbone de prairies154
- 10. Sols légèrement acides et riches en carbone de plaines cultivées156
- 11. Sols acido-neutres de plaines cultivées158
- 12. Sols acido-neutres de forêts de feuillus160
- 13. Sols acido-neutres de prairies et de milieux peu anthropisés162
- 14. Sols alcalins de forêts164
- 15. Sols alcalins des plaines cultivées du Nord et de l'Est166
- 16. Sols alcalins des plaines du Sud-Ouest, du pourtour méditerranéen et du centre de la France168
- Synthèse des fiches « Habitat » 170
- Annexes173
- Glossaire, abréviations, sigles174
- Références bibliographiques179
- Partenaires privés184
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Origine de la notice:
- Electre
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