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Livre

Bactériologie médicale : techniques usuelles

Résumé

Un manuel technique pour pratiquer des analyses bactériologiques en laboratoire avec des photos et schémas, des rappels, des tableaux et des encadrés. Cette nouvelle édition actualise les nouvelles technologies (PCR en temps réel...) et fait le point sur les nouveaux textes encadrant l'activité du biologiste.


  • Éditeur(s)
  • Date
    • 2011
  • Langues
    • Français
  • Description matérielle
    • 1 vol. (580 p.) : illustrations en noir et en couleur ; 27 x 21 cm
  • Sujet(s)
  • ISBN
    • 978-2-294-09668-6
  • Indice
    • 577.6 Microbiologie, bactériologie, parasitologie
  • Quatrième de couverture
    • Parmi les ouvrages de bactériologie, très peu ont l'ambition d'être pratiques, utilisables au quotidien, autrement dit d'être des ouvrages de paillasse. C'est le cas de cet ouvrage qui traite de la bactériologie «au quotidien».

      Le succès de la 1re édition de l'ouvrage paru en 2007 et l'évolution des techniques justifient quatre ans plus tard une nouvelle édition. Plus qu'une simple réactualisation il s'agit également d'une véritable évolution avec de très nombreux nouveaux chapitres abordant des sujets jusqu'alors non traités.

      Véritable synthèse de la spécialité, ce manuel est organisé en quatre parties : technologie générale, étude bactériologique des produits pathologiques, identification et systématique bactérienne, rôle du laboratoire dans l'instauration et la surveillance d'un traitement antibiotique. Au sein de ces parties, une quarantaine de chapitres abordent les germes sous l'angle taxonomique, mais aussi dans leur ensemble, dans le contexte des produits pathologiques. Les différents problèmes de gestion d'un laboratoire de bactériologie sont également abordés. Les chapitres sont facilement consultables et les informations recherchées très accessibles par un recours important aux encadrés, aux tableaux, ainsi qu'à des schémas et dessins originaux.

      Cet ouvrage tout en couleur fait le point sur les techniques actuelles, mais aussi sur les démarches allant de l'approche pasteurienne à la biologie moléculaire, des techniques classiques de base aux automates et à l'informatique. On y trouvera également toutes les informations pratiques concernant notamment les centres nationaux de référence et une bibliographie de référence.

      Il s'adresse à tous les biologistes, spécialisés ou non en bactériologie, mais aussi à tous les cliniciens concernés par les infections microbiennes.


  • Tables des matières
      • Bactériologie médicale Techniques usuelles

      • François Denis/Marie-Cécile Ploy/Christian Martin/Édouard Bingen/Roland Quentin

      • Elsevier Masson

      • Liste des collaborateurs V
      • Abréviations IX
      • Introduction XV
      • Partie I Technologies générales
      • Chapitre 1 Remarques liminaires 3
      • F. Denis
      • Chapitre 2 Démarche de l'examen bactériologique 5
      • P. Lanotte, L. Mereghetti, R. Quentin
      • Prélèvements 5
      • Schéma de la démarche 5
      • Examen microscopique 5
      • Culture et isolement des bactéries 13
      • Tests biochimiques utilisés dans l'identification des bactéries 20
      • Chapitre 3 Diagnostic rapide en bactériologie par recherche d'antigènes 35
      • F. Denis, M.-C. Ploy
      • Antigènes recherchés 35
      • Techniques utilisées 35
      • Trousses commerciales 37
      • Conclusion 41
      • Chapitre 4 Biologie moléculaire : application à la détection, à l'identification et au génotypage 43
      • F. Garnier, C. Burucoa, P. Lanotte
      • Organisation d'un laboratoire de biologie moléculaire 43
      • Principes de la biologie moléculaire 44
      • Applications de la biologie moléculaire en bactériologie médicale 54
      • Typage génétique des bactéries 59
      • Précautions 61
      • Évolutions 62
      • Chapitre 5 Automatisation et laboratoire de bactériologie 65
      • C. Martin, F. Garnier
      • Généralités 65
      • Automates de coloration 65
      • Automates de cytologie urinaire et de détection de la bactériurie 67
      • Gestion des hémocultures 67
      • Automates d'identification et d'antibiogramme 67
      • Automates de détection des mycobactéries et étude de la sensibilité aux antibiotiques 70
      • De l'automate d'ensemencement à la chaîne robotisée 73
      • Perspectives et conclusions 73
      • Chapitre 6 Stérilisation 75
      • A. Cubertafond, M. Mounier, F. Denis
      • Indications 75
      • Définitions 75
      • Étapes préliminaires de la stérilisation 75
      • Autres méthodes de stérilisation 78
      • Chapitre 7 Informatique et laboratoire de bactériologie 79
      • C. Martin
      • Généralités 79
      • Gestion du laboratoire 79
      • Logiciels d'épidémiologie 84
      • Chapitre 8 Internet et bactériologie médicale 87
      • A. Philippon
      • Introduction 87
      • Quelles informations rechercher ? 87
      • Choix d'un méta-moteur de recherche 87
      • Carnet d'adresses 88
      • Conclusion 89
      • Chapitre 9 Sécurité biologique au laboratoire de bactériologie 91
      • M. Mounier, N. Hidri, M.-C. Ploy, F. Denis
      • Risque infectieux 91
      • Conception du laboratoire 95
      • Protections individuelles 99
      • Gestes de routine 101
      • Risques particuliers : biologie moléculaire, organismes génétiquement modifiés (OGM) 101
      • Gestion des déchets 103
      • Conclusion 104
      • Chapitre 10 L'accréditation au laboratoire de bactériologie 109
      • N. Hidri, V. Marzuck
      • Généralités 109
      • Particularités de la bactériologie 113
      • Conclusion 115
      • Chapitre 11 Rôle du laboratoire dans le dépistage des porteurs de germes à potentiel infectieux ou multirésistants (staphylocoques, salmonelles, Clostridium difficile, BMR, ERV, etc.) 117
      • O. Barraud, N. Pestourie
      • Introduction 117
      • Germes à potentiel infectieux ou multirésistants 117
      • Politique de dépistage 118
      • Outils de dépistage 119
      • Conduite à tenir du biologiste devant la détection d'une BMR 127
      • Chapitre 12 Microbiologie en post mortem 129
      • F. Denis, C. Piva, M. Mounier
      • Flore bactérienne ante mortem et post mortem 129
      • Diagnostic microbiologique sur cadavre 131
      • Cas particulier de la mort «subite» du nourrisson et de l'enfant 132
      • Précautions à respecter lors de la conservation des corps des autopsies et de la mise en bière 132
      • Conclusion 132
      • Partie II Étude bactériologique des produits pathologiques
      • Chapitre 13 Généralités 137
      • F. Denis
      • Chapitre 14 Hémocultures 139
      • F. Garnier, F. Denis
      • Vitalité des corps bactériens dans les flacons d'hémocultures 139
      • Milieux d'hémocultures 139
      • Systèmes 140
      • Prélèvements 141
      • Traitement des flacons ensemencés 144
      • Interprétation 145
      • Chapitre 15 Endocardites 149
      • P. Parize, J.-L. Mainardi
      • Introduction 149
      • Micro-organismes 149
      • Physiopathologie 151
      • Diagnostic 152
      • Traitement 154
      • Conclusion 156
      • Chapitre 16 Diagnostic bactériologique et suivi biologique des méningites bactériennes 159
      • P. Mariani-Kurkdjian, E. Bingen
      • Prélèvement de LCR 159
      • Démarche diagnostique 159
      • Autres examens biologiques 165
      • Chapitre 17 Analyse bactériologique des selles 167
      • P. Mariani-Kurkdjian, E. Bingen
      • Introduction 167
      • Prélèvements 167
      • Démarche diagnostique 168
      • Chapitre 18 Examen cytobactériologique des urines (ECBU) 179
      • S. Bonacorsi
      • Données physiopathologiques 179
      • Prélèvement et acheminement 179
      • Techniques d'analyse au laboratoire 180
      • Interprétation des urocultures 184
      • Contextes particuliers 186
      • Chapitre 19 Examens bactériologiques des sécrétions trachéobronchiques (hors mycobactéries) 189
      • C. Martin, F. Garnier, M.-C. Ploy, F. Denis
      • Introduction 189
      • Rappels anatomocliniques 189
      • Pathogenèse 190
      • Diagnostic bactériologique direct 190
      • Diagnostic bactériologique indirect 194
      • Cas particuliers de la mucoviscidose 194
      • Conclusion 197
      • Chapitre 20 Analyse cytobactériologique des pus 199
      • M.-C. Ploy, F. Denis
      • Introduction 199
      • Rappel anatomoclinique 199
      • Pathogenèse 199
      • Diagnostic bactériologique direct 199
      • Chapitre 21 Analyse bactériologique des matériels 205
      • M.-C. Ploy
      • Introduction 205
      • Rappel anatomoclinique 205
      • Pathogenèse 205
      • Diagnostic bactériologique direct 205
      • Chapitre 22 Liquides d'épanchement 209
      • M.-C. Ploy, C. Martin
      • Introduction 209
      • Rappels anatomopathologiques 209
      • Pathogenèse 209
      • Diagnostic bactériologique direct 210
      • Chapitre 23 Prélèvements de la sphère oropharyngée 215
      • P. Mariani-Kurkdjian, E. Bingen
      • Prélèvements pharyngés 215
      • Prélèvements auriculaires 218
      • Prélèvements nasal et rhinopharyngé, pus de sinus 219
      • Chapitre 24 Infections oculaires 223
      • F. Denis, M.-C. Ploy, M. Mounier
      • Introduction 223
      • Rappel anatomoclinique 223
      • Diagnostic bactériologique 224
      • Conclusion 227
      • Chapitre 25 Prélèvements génitaux chez l'homme 229
      • L. Mereghetti, P. Lanotte, R. Quentin
      • Introduction 229
      • Ulcérations génitales 229
      • Urétrites 232
      • Prostatites, épididymites et orchiépididymites 235
      • Rôle du laboratoire dans la surveillance de l'infection 236
      • Chapitre 26 Prélèvements génitaux chez la femme 237
      • R. Quentin, P. Lanotte, L. Mereghetti
      • Introduction 237
      • Rappel anatomoclinique 237
      • Pathogenèse 239
      • Diagnostic bactériologique 240
      • Conclusion 253
      • Chapitre 27 Prélèvements chez le nouveau-né 255
      • R. Quentin
      • Introduction 255
      • Rappel clinique 255
      • Pathogénie 255
      • Diagnostic bactériologique direct 257
      • Chapitre 28 Prélèvements bactériologiques et assistance médicale à la procréation 265
      • L. Mereghetti, P. Lanotte, R. Quentin
      • Introduction 265
      • Diagnostic bactériologique direct chez l'homme 265
      • Diagnostic bactériologique direct chez la femme 266
      • Diagnostic bactériologique indirect 267
      • Contrôle des milieux de culture 267
      • Chapitre 29 Incidents transfusionnels d'origine bactérienne : rôle du laboratoire 269
      • F. Garnier, F. Denis
      • Épidémiologie des accidents bactériens 269
      • Prise en charge de la poche au laboratoire 269
      • Prélèvement 270
      • Examen microscopique 270
      • Mise en culture 270
      • Résultats 271
      • Espèces bactériennes incriminées 271
      • Conclusion 274
      • Chapitre 30 Contrôle microbiologique des tissus et des cellules à usage thérapeutique 275
      • F. Garnier, M. Drouet, F. Denis
      • Produits thérapeutiques d'origine humaine 275
      • Étapes du procédé de production des produits humains à usage thérapeutique 275
      • Contrôles microbiologiques 278
      • Partie III Identification et systématique bactérienne
      • Chapitre 31 Orientation générale 283
      • M.-C. Ploy, F. Denis
      • Chapitre 32 Cocci à Gram positif 287
      • F. Garnier, F. Denis
      • Famille des Micrococcaceae 287
      • Famille des Streptococcaceae 299
      • Chapitre 33 Cocci à Gram négatif 321
      • F. Garnier, M.-C. Ploy, F. Denis
      • Habitat, pouvoir pathogène 321
      • Diagnostic bactériologique direct 323
      • Prise en charge et prophylaxie des infections invasives à méningocoque 329
      • Chapitre 34 Bacilles à Gram négatif aérobies et aéro-anaérobies 331
      • Chapitre 34.1 Généralités 331
      • F. Denis, M.-C. Ploy
      • Chapitre 34.2 Enterobacteriaceae (à l'exception du genre Yersinia) 331
      • P. Bidet, E. Bingen
      • Généralités 331
      • Tribu des Escherichiae (entérobactéries VP -, TDA - et uréase -) 336
      • Groupe KES (entérobactéries VP +), tribu des Klebsiellae 350
      • Tribu des Proteae (entérobactéries TDA +) 353
      • Chapitre 34.3 Vibrionaceae - Aeromonadaceae - Plesiomonas 361
      • O. Barraud, F. Denis, M.-C. Ploy
      • Généralités 361
      • Genre Vibrio 361
      • Genre Aeromonas 366
      • Genre Plesiomonas 367
      • Chapitre 34.4 Bacilles à Gram négatif non fermentaires 368
      • C. Martin
      • Généralités 368
      • Genre Pseudomonas 372
      • P. aeruginosa et groupe «fluorescent» 372
      • Genres Burkholderia, Acidovorax, Comamonas, Brevundimonas, Ralstonia, Pandoraea, Sphingomonas, Stenotrophomonas 375
      • Genres Ralstonia et Pandoraea 377
      • Genres Stenotrophomonas, Acidovorax, Comamonas et Brevundimonas 377
      • Famille des Flavobacteriaceae (Flavobacterium, Chryseobacterium, Sphingobacterium, Myroides, Weeksella, Empedobacter) et genres Alcaligenes, Achromobacter, Agrobacterium, Ochrobactrum, Shewanella et Weeksella 378
      • Chapitre 34.5 Acinetobacter 382
      • Bacilles à Gram négatif exigeants 385
      • Chapitre 34.6 Bordetella 385
      • F. Garnier, M.-C. Ploy
      • Chapitre 34.7 Moraxella et Oligella 388
      • F. Denis, M.-C. Ploy
      • Chapitre 34.8 Francisella 390
      • F. Denis, M.-C. Ploy
      • Chapitre 34.9 Pasteurella 392
      • F. Denis, M.-C. Ploy
      • Chapitre 34.10 Autres bacilles à Gram négatifs isolés de morsures 394
      • F. Denis, M.-C. Ploy
      • Chapitre 34.11 Haemophilus 394
      • O. Barraud, F. Denis, M.-C. Ploy
      • Chapitre 34.12 Yersinia 400
      • F. Denis, M.-C. Ploy
      • Chapitre 34.13 Bactéries du groupe HACEK 404
      • P. Riegel
      • Chapitre 34.14 Afipia, Bartonella : agents de la maladie des griffes du chat 411
      • F. Denis, C. Martin
      • Chapitre 34.15 Brucella 413
      • J.-P. Lavigne, D. O'Callaghan
      • Chapitre 34.16 Legionella 421
      • M. Mounier, F. Denis, N. Pestourie
      • Chapitre 35 Bacilles à Gram négatif microaérophiles 429
      • Chapitre 35.1 Campylobacter 429
      • C. Burucoa
      • Chapitre 35.2 Helicobacter pylori 434
      • C. Burucoa
      • Chapitre 36 Bacilles à Gram positif (à l'exception des anaérobies) 443
      • Chapitre 36.1 Corynebacterium et germes apparentés 444
      • O. Barraud, F. Denis, M.-C. Ploy
      • Chapitre 36.2 Erysipelothrix rhusiopathiae ou bacille du rouget du porc 453
      • J. Tankovic
      • Chapitre 36.3 Lactobacillus 455
      • J. Tankovic
      • Chapitre 36.4 Listeria 458
      • F. Denis, F. Garnier, M.-C. Ploy
      • Chapitre 36.5 Nocardia 463
      • C. Martin
      • Chapitre 36.6 Tropheryma whipplei 467
      • C. Martin
      • Chapitre 36.7 Bacillus 470
      • F. Denis, M.-C. Ploy
      • Chapitre 37 Bactéries spiralées 475
      • B. Jaulhac, S. de Martino, C. Le Brun
      • Chapitre 37.1 Généralités sur les spirochètes 475
      • B. Jaulhac, S. de Martino, C. Le Brun
      • Chapitre 37.2 Genre Borrelia 476
      • B. Jaulhac, S. de Martino, C. Le Brun
      • Généralités 476
      • Épidémiologie 477
      • Clinique 478
      • Caractères bactériologiques 482
      • Traitement 486
      • Conclusion 487
      • Chapitre 37.3 Genre Leptospira 487
      • B. Jaulhac, S. de Martino, C. Le Brun
      • Généralités 487
      • Épidémiologie et pouvoir pathogène naturel 488
      • Caractères bactériologiques 489
      • Diagnostic bactériologique 489
      • Traitement 491
      • Chapitre 37.4 Genre Treponema 492
      • B. Jaulhac, S. de Martino, C. Le Brun
      • Généralités 492
      • Épidémiologie et pouvoir pathogène naturel 492
      • Caractères bactériologiques 493
      • Diagnostic direct 493
      • Diagnostic indirect ou sérologique 494
      • Traitement 503
      • Conclusion 503
      • Chapitre 38 Mycobactéries 507
      • C. Martin, F. Denis
      • Généralités 507
      • Habitat et pouvoir pathogène 508
      • Démarche diagnostique 510
      • Règles de sécurité et législation 510
      • Prélèvements 512
      • Décontamination, fluidification, concentration 513
      • Examen microscopique 514
      • Méthodes de culture 518
      • Identification 520
      • Détection génomique 526
      • Diagnostic immunologique rapide 533
      • Recherche du bacille de la lèpre 534
      • Chapitre 39 Mycoplasmes 537
      • C. Bébéar, C.M. Bébéar
      • Généralités 537
      • Pouvoir pathogène et habitat 537
      • Caractères généraux 538
      • Diagnostic bactériologique direct 538
      • Étude de la sensibilité aux antibiotiques 542
      • Sérologies 543
      • Chapitre 40 Bactéries cytoparasites obligatoires 545
      • Chapitre 40.1 Chlamydia 545
      • B. de Barbeyrac
      • Chapitre 40.2 Coxiella burnetii 553
      • S. Ranger-Rogez
      • Chapitre 40.3 Rickettsies - Rickettsia conorii 558
      • S. Ranger-Rogez
      • Chapitre 40.4 Ehrlichia 562
      • S. Ranger-Rogez
      • Chapitre 41 Bactéries anaérobies strictes 565
      • L. Dubreuil
      • Avant-propos 565
      • Flores humaines anaérobies 565
      • Habitat et pouvoir pathogène 565
      • Conduite de l'analyse bactériologique 566
      • Identification des anaérobies stricts 569
      • Partie IV Rôle du laboratoire dans l'instauration et la surveillance d'un traitement antibiotique
      • Chapitre 42 Instauration et surveillance d'un traitement antibiotique 585
      • N. Hidri, M.-C. Ploy
      • Bactériostase et bactéricidie 585
      • Antibiogramme 587
      • Techniques génotypiques de détection de la résistance 591
      • Étude des associations d'antibiotiques 591
      • Rôle du laboratoire de bactériologie dans la surveillance d'un traitement antibiotique 593
      • Rôle du laboratoire dans la surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 593
      • Chapitre 43 Dosage des antibiotiques : pourquoi, comment ? 595
      • F. Jehl
      • Pourquoi 595
      • Comment 603
      • Conclusion 610
      • Partie V Démarches, documentation et adresses utiles
      • Chapitre 44 Liste des maladies bactériennes à déclaration obligatoire (MDO) 614
      • Chapitre 45 Centres nationaux de référence (CNR 2006-2011) 616
      • Chapitre 46 Liste et adresses des principales sociétés 620
      • Chapitre 47 Ouvrages et documents de référence 623
      • Index 625

  • Origine de la notice:
    • Electre
  • Disponible - 577.6 BAC

    Niveau 2 - Sciences