Respiration et photosynthèse
Histoire et secrets d'une équation
Claude Lance
edp sciences
Avant-ProposI
RemerciementsV
Première Partie - Philosophie7
Chapitre 1 - De l'Antiquité à la fin du Moyen Âge11
1.1 - L'Antiquité12
1.1.1 - La théorie des quatre éléments12
1.1.2 - Les atomistes14
1.2 - Les alchimistes16
1.3 - Le souffle et la respiration17
1.4 - La situation à la fin du Moyen Âge23
Chapitre 2 - La fracture du système27
2.1 - Des révolutions à foison27
2.1.1 - Chimie : d'autres éléments28
2.1.2 - Médecine : la circulation du sang29
2.1.3 - Physique : le vide32
2.2 - La naissance des gaz35
2.2.1 - Un nouveau concept : gaz36
2.2.2 - Les gaz sylvestres37
2.3 - La situation à la fin du XVIIe siècle38
Chapitre 3 - La découverte des gaz41
3.1 - Les instruments du progrès41
3.1.1 - La manipulation des gaz42
3.1.2 - Les autres instruments de mesure43
3.2 - La phlogistique49
3.2.1 - La théorie du phlogistique50
3.2.2 - Les problèmes du phlogistique52
3.3 - Les nouveaux airs54
3.3.1 - L'air fixe55
3.3.2 - L'air inflammable57
3.3.3 - L'air déphlogistiqué58
3.3.4 - L'air méphitique61
Chapitre 4 - La révolution chimique63
4.1 - Antoine-Laurent Lavoisier64
4.2 - Combustion et calcination67
4.3 - La fin des éléments70
4.3.1 - La composition de l'air70
4.3.2 - La synthèse et la décomposition de l'eau72
4.4 - Calorique et calorimétrie77
4.4.1 - La théorie du calorique77
4.4.2 - La calorimétrie78
4.5 - La chimie des substances végétales et animales81
4.6 - La nouvelle chimie82
4.6.1 - La nouvelle nomenclature chimique83
4.6.2 - La chimie de Lavoisier84
Chapitre 5 - La respiration89
5.1 - L'évolution d'une idée90
5.1.1 - Les précurseurs lointains90
5.1.2 Les précurseurs proches92
5.1.3 - Les Chimistes d'Oxford94
5.2 - Les modifications de l'air dans la respiration97
5.2.1 - L'addition d'air fixe97
5.2.2 - L'addition de phlogistique98
5.3 - La contribution de Lavoisier100
5.3.1 - La chimie de la respiration101
5.3.2 - L'absorption d'oxygène et le rejet de gaz carbonique103
5.3.3 - La formation d'eau104
5.3.4 - La libération de calorique105
5.3.5 - La physiologie de la respiration107
5.4 - Les fermentations111
Chapitre 6 - Comment le carbone vient aux plantes117
6.1 - Le « rétablissement » de l'air vicié119
6.1.1 - La déphlogistication de l'air119
6.1.2 - L'émission d'oxygène123
6.2 - La nécessité de la lumière124
6.3 - L'absorption du gaz carbonique128
6.4 - L'origine atmosphérique du carbone des végétaux132
6.5 - La participation de l'eau136
6.6 - Synthèse138
Deuxième Partie - Chimie et physiologie143
Chapitre 7 - Atomes, molécules et énergie147
7.1 - Les lois de la chimie148
7.1.1 - Les lois des combinaisons chimiques148
7.1.2 - La théorie atomique de Dalton149
7.1.3 - Une écriture symbolique152
7.1.4 - Une écriture quantifiée154
7.2 - L'énergie156
7.2.1 - Le concept d'énergie156
7.2.2 - Les formes de l'énergie158
7.3 - Vues nouvelles sur la respiration et la photosynthèse160
Chapitre 8 - La fonction chlorophyllienne165
8.1 - Un problème d'identité165
8.2 - Photosynthèse et respiration à la lumière168
8.3 - L'assimilation du carbone173
8.3.1 - La chlorophylle et les corps chlorophylliens174
8.3.2 - L'amidon et les sucres176
8.4 - À la recherche du composé primaire180
Chapitre 9 - La respiration cellulaire185
9.1 - Le siège de la respiration186
9.1.1 - La respiration sanguine187
9.1.2 - La respiration tissulaire188
9.1.3 - La respiration cellulaire190
9.2 - Le transport des gaz respiratoires191
9.1.2 - Le transport des gaz par le sang192
9.2.2 - L'hémoglobine193
9.2.3 - Le transport des gaz chez les animaux196
9.2.4 - Le transport des gaz chez les végétaux200
9.3 - Les combustibles respiratoires203
9.3.1 - Le Quotient Respiratoire203
9.3.2 - La glycogenèse207
Chapitre 10 - Chaleur et travail213
10.1 - La chaleur animale213
10.1.1 - La température des animaux215
10.1.2 - La température du sang216
10.2 - La chaleur végétale217
10.3 - Le travail musculaire221
10.3.1 - Le travail physiologique221
10.3.2 - La force vitale222
10.3.3 - Température et travail musculaire224
10.3.4 - Le glucose, source de l'énergie animale227
10.4 - La machine animale231
10.4.1 - Thermochimie et calorimétrie231
10.4.2 - Le moteur humain234
10.5 - Le crépuscule des mythes237
Chapitre 11 - La capture de la lumière241
11.1 - La lumière242
11.1.1 - La propagation de la lumière242
11.1.2 - L'absorption de la lumière245
11.1.3 - L'énergie lumineuse247
11.2 - Les pigments des végétaux248
11.2.1 - Pigments verts et pigments jaunes249
11.2.2 - Pigments bleus et pigments rouges252
11.3 - La capture de l'énergie lumineuse253
11.3.1 - Photosynthèse et absorption des radiations lumineuses254
11.3.2 - Photosynthèse et absorption de l'énergie lumineuse259
Chapitre 12 - La vie sans air263
12.1 - Fermentation et putréfaction263
12.1.1 - Les causes de la fermentation264
12.1.2 - La levure n'est pas une substance chimique266
12.2.3 - La fermentation alcoolique270
12.2 - L'air et la fermentation273
12.2.1 - L'origine des causes de la fermentation273
12.2.2 - Les fermentations278
12.2.3 - Aérobiose et anaérobiose282
12.2.4 - L'anaérobiose chez les végétaux et les animaux283
12.3 - La fermentation sans la levure285
12.3.1 - La dissymétrie moléculaire285
12.3.2 - Ferments diastases et enzymes288
12.3.3 - La zymase290
Troisième Partie - Biochimie293
Chapitre 13 - Nouveaux concepts297
13.1 - La découverte de l'atome298
13.1.1 - Le nombre d'Avogadro298
13.1.2 - Les rayons et la radioactivité299
13.1.3 - La structure de l'atome301
13.1.4 - Les isotopes303
13.2 - Vues nouvelles en chimie305
13.2.1 - La liaison chimique305
13.2.2 - La dissociation des molécules307
13.2.3 - L'oxydoréduction309
13.3 - La quantification de la lumière311
13.4 - La théorie des processus vitaux315
13.4.1 - La théorie protoplasmique de la vie315
13.4.2 - La théorie enzymatique de la vie317
Chapitre 14 - Les voies du métabolisme énergétique321
14.1 - La glycolyse323
14.1.1 - L'impact de la glycolyse323
14.1.2 - Cozymase et coenzymes324
14.1.3 - Les premières théories de la glycolyse325
14.1.4 - Les intermédiaires phosphorylés326
14.1.5 - L'étape oxydative328
14.1.6 - L'assemblage du puzzle331
14.2 - Le cycle de Krebs335
14.2.1 - Les acides di- et tricarboxyliques335
14.2.2 - Le cycle de Krebs339
14.2.3 - L'acétate actif et la synthèse du citrate340
14.3 - La dégradation des acides gras344
14.3.1 - Les corps cétoniques dans le diabète344
14.3.2 -Nature et destinée des fragments dicarbonés345
14.4 - La voie d'oxydation directe du glucose347
14.4.1 - La voie des hexoses monophosphates348
14.4.2 - Le cycle des pentoses phosphates349
Chapitre 15 - Oxydations353
15.1 - Méthodologies354
15.1.1 - Techniques d'analyse354
15.1.2 - La mitochondrie, siège de la respiration358
15.2 - Théories362
15.2.1 - Premières théories sur les oxydations respiratoires362
15.2.2 - Activation de l'hydrogène363
15.2.3 - Activation de l'oxygène365
15.3 - Transporteurs368
15.3.1 - Transporteurs flaviniques368
15.3.2 - Transporteurs pyridiniques370
15.3.3 - Les cytochromes372
15.3.4 - Autres transporteurs378
15.4 - La chaîne respiratoire379
15.4.1 - Stratégies mises en jeu380
15.4.2 - Organisation de la chaîne respiratoire383
15.5 - Rétrospectives390
Chapitre 16 - Phosphorylations397
16.1 - Les réactions de phosphorylation398
16.2 - Les transferts d'énergie399
16.3 - Les composés « riche en énergie »402
16.3.1 - La liaison phosphate403
16.3.2 - Liaison « riche en énergie »405
16.3.3 - Le cycle métabolique du phosphate410
16.4 - Phosphorylation liée au substrat413
16.4.1 - La génération des liaisons riches en énergie (~)413
16.4.2 - La formation de l'ATP415
16.5 - Phosphorylation oxydative417
16.5.1 - Mise en évidence417
16.5.2 - Le rapport P/O419
16.5.3 - Les sites de phosphorylation421
16.5.4 - Théorie chimique de la phosphorylation oxydative426
16.5.5 - À la recherche de X~428
16.6 - Bilans430
Chapitre 17 - La photosynthèse révélée433
17.1 - Une lente évolution des concepts433
17.2 - L'intervention de la lumière436
17.2.1 - Le rendement quantique de la photosynthèse436
17.2.2 - Réactions claires et réactions sombres439
17.2.3 - L'unité photosynthétique et les quantasomes441
17.3 - L'incorporation du dioxyde de carbone445
17.3.1 - Des révolutions technologiques445
17.3.2 - Carboxylation et premiers produits de la photosynthèse447
17.3.3 - Réduction de l'acide phosphoglycérique451
17.3.4 - Régénération de l'accepteur de CO2454
17.4 - La source du pouvoir réducteur456
17.4.1 - L'oxydoréduction photosynthétique457
17.4.2 - Le transport d'électrons photosynthétique461
17.4.3 - Le schéma en Z463
17.4.4 - Les photosystèmes466
17.4.5 - L'organisation du système de transport d'électrons472
17.5 - La photophosphorylation473
17.5.1 - Le besoin d'ATP474
17.5.2 - La synthèse d'ATP dans les chloroplastes475
Chapitre 18 - Membranes et force proton-motrice481
18.1 - Les membranes biologiques482
18.1.1 - Ultrastructure cellulaire482
18.1.2 - Constitution et organisation des membranes biologiques487
18.1.3 - Compartimentation métabolique492
18.2 - La théorie chimiosmotique495
18.2.1 - Des preuves... élusives495
18.2.2 - Les prémisses d'une nouvelle théorie498
18.2.3 - La théorie originelle500
18.2.4 - Des preuves... irréfutables506
18.2.5 - Topologie membranaire510
18.3 - La force proton-motrice513
18.4 - L'ATP synthase518
Chapitre 19 - Unité et Diversité525
19.1 - Unité526
19.1.1 - Les étapes d'une longue marche526
19.1.2 - Les secrets d'une équation529
19.1.3 - Un mécanisme unitaire et universel535
19.2 - Diversité539
19.2.1 - Les photosynthèses539
19.2.2 - Les respirations545
19.2.3 - Les autotrophies548
19.2.4 - Les thermogenèses549
19.3 - Épilogue : À l'ère de la biologie moléculaire552
Annexes561
Annexe A - Équations562
Annexe B - Glycolyse564
Annexe C - Cycle de Krebs565
Annexe D - Bêta-oxydation des acides gras566
Annexe E - Voie des hexoses monophosphates567
Annexe F - Transporteurs d'électrons568
Annexe G - Cycle de Calvin569
Annexe H - Lipides membranaires570
Bibliographie571
Index des auteurs581
Index chronologique589