Les longs ARN non codants : la face cachée des génomes

Auteur(s) :

Morillon, Antonin Découvrir l'auteur

Résumé

Etat de l'art de la recherche sur les ARN non codant humains qui occupent jusqu'à 98 % du génome. L'auteur passe en revue les hypothèses concernant leurs rôles fondamentaux (identité cellulaire, biologie du développement) et thérapeutiques (développement et progression des cancers). Il détaille aussi leurs mécanismes de régulation et leurs liens avec l'épigénétique ou l'expression du génome. ©Electre 2018

Éditeur(s)
- ISTE editions
Date
- 2018
Notes
- Glossaire. Bibliogr. Index
Langues
- Français
Description matérielle
- 1 vol. (149 p.) : ill. en coul. ; 24 cm
Collections
- Série ARN
Sujet(s)
ISBN
- 9781784054205 ;
- 1784054208 ;
- 9781784064204
Indice
- 611.5 Génétique humaine
Quatrième de couverture
- ARN
  La face cachée du génome représente de vastes domaines qui ne codent pas pour les protéines. Jusqu'à 98 % du génome humain est non codant et produit des ARN du même nom. Certains de ces longs ARN non codants jouent des rôles fondamentaux dans l'identité cellulaire, le développement et la progression du cancer. Ils sont maintenant largement étudiés dans de nombreux organismes pour comprendre leur fonction.
  Cet ouvrage passe en revue ce champ de recherche en rapide expansion et présente les larges diversités fonctionnelles de ces molécules et leurs rôles hypothétiques fondamentaux et thérapeutiques. Il examine l'histoire récente des ARN non codants, leur classification très controversée et comment ils suscitent un formidable intérêt pour la biologie du développement et la tumorigenèse. Il illustre les exemples les plus étudiés et attrayants de ces longs ARN, leur interface avec l'épigénétique, l'intégrité et l'expression du génome ainsi que les modèles actuels de leurs mécanismes de régulation.
Tables des matières
- - Les longs ARN non codants
  - La face cachée des génomes
  - Marie-Christine Maurel
  - Antonin Morillon
  - iSTE editions
  - Préface 9
  - John S. Mattick
  - Avant-propos 15
  - Chapitre 1. Les ARN non codants : histoire et chronologie de leur découverte17
  - 1.1. La biologie des ARN, un centenaire d'histoire19
  - 1.1.1. De la nucléine à la double hélice19
  - 1.1.2. Le concept RNA world19
  - 1.1.3. Les petits ARN bactériens : pionniers des ARN non codants21
  - 1.1.4. Les micro-ARN et l'interférence ARN23
  - 1.2. La découverte des longs ARN non codants durant l'ère prégénomique25
  - 1.2.1. H19 : le premier des longs ARN non codants de l'histoire25
  - 1.2.2. Inactivation du X, l'eXlSTence de XIST26
  - 1.3. Du génome non codant vers le transcriptome non codant, l'avènement de l'ère génomique29
  - 1.3.1. Le projet du génome humain : l'ADN génomique est essentiellement non codant30
  - 1.3.2. La transcription permissive et la face cachée du génome31
  - Chapitre 2. Définition et familles des longs ARN non codants35
  - 2.1. Le portrait du suspect idéal concernant les longs ARN non codants35
  - 2.1.1. Le potentiel codant des ARN non codants35
  - 2.1.2. La transcription des IncARN et l'organisation de leur transcrit37
  - 2.1.3. Les signatures chromatiniennes des gènes de IncARN38
  - 2.1.4. L'expression des IncARN : leur stabilité, spécificité et abondance39
  - 2.1.5. La répartition cellulaire des IncARN40
  - 2.1.6. La structure des IncARN41
  - 2.2. Classification des IncARN41
  - 2.2.1. En fonction de leur taille42
  - 2.2.2. En fonction de leur localisation par rapport aux promoteurs des gènes42
  - 2.2.2.1. Les IncARN antisens43
  - 2.2.2.2. Les IncARN bidirectionnels45
  - 2.2.2.3. Les IncARN introniques et circulaires45
  - 2.2.2.4. Les IncARN chevauchant les ARN messagers46
  - 2.2.3. En fonction de leur positionnement par rapport à des éléments régulateurs de l'ADN46
  - 2.2.3.1. Les IncARN dérivés des pseudogènes46
  - 2.2.3.2. Les IncARN dérivés de régions ultraconservées47
  - 2.2.3.3. Les IncARN contenant des répétitions47
  - 2.2.3.4. Les IncARN des régions enhancer et promoteurs de gènes48
  - 2.2.4. En fonction de leur biogenèse et dégradation49
  - 2.2.5. En fonction de leur répartition dans la cellule51
  - 2.2.6. L'annotation des IncARN : un challenge à relever51
  - Chapitre 3. Fonctions biologiques des longs ARN non codants57
  - 3.1. ARN non codants : déchets ou éléments fonctionnels des génomes ?57
  - 3.1.1. D'où viennent les ARN non codants ?57
  - 3.1.2. Conservation et évolution des IncARN59
  - 3.2. Fonctions des IncARN dans la diversité biologique60
  - 3.3. Les fonctions répertoriées des IncARN61
  - 3.3.1. Les IncARN « échafaudage »62
  - 3.3.2. Les IncARN architecturaux (arcARN)63
  - 3.3.3. Les IncARN « guides »63
  - 3.3.4. Les IncARN « leurres »63
  - 3.3.5. Les lncARN compétiteurs des ARN endogènes (ceARN)64
  - 3.3.6. Les IncARN précurseurs des miARN64
  - 3.4. Classification en fonction de l'association à des processus biologiques65
  - Chapitre 4. Les ARN non codants dans le développement67
  - 4.1. Inactivation du chromosome X67
  - 4.1.1. Identification et expression de XIST67
  - 4.1.2. Mécanisme de régulation de XIST68
  - 4.2. L'empreinte génomique68
  - 4.3. Régulation des gènes HOX69
  - 4.3.1. Les IncARN agissant en cis69
  - 4.3.2. Les IncARN agissant en trans71
  - 4.4. Pluripotence par opposition à initiation de la différenciation cellulaire71
  - 4.5. Développement du cerveau et du système nerveux central (SNC)73
  - 4.5.1. Les IncARN abondants du système nerveux73
  - 4.5.2. Les IncARN associés à l'expression des protéines du développement neuronal73
  - 4.5.3. Les IncARN de la rétine74
  - 4.5.4. Les circARN du cerveau74
  - 4.6. Développement des autres organes75
  - 4.6.1. Le coeur75
  - 4.6.2. Les muscles du squelette75
  - 4.7. Développement des cellules de la peau, du sang et adipeuses77
  - Chapitre 5. Les longs ARN non codants et le cancer79
  - 5.1. Identifier les signaux des IncARN dans les transcriptomes de cancer82
  - 5.2. Les IncARN, drivers des phénotypes de cancer84
  - 5.2.1. LncARN, nouveaux suppresseurs de tumeurs ?84
  - 5.2.2. Les circuits de prolifération86
  - 5.2.2.1. LncARN et les voies hormonales86
  - 5.2.2.2. LncARN et l'oncogène MYC86
  - 5.2.3. Les circuits de longévité cellulaire88
  - 5.2.3.1. LncARN et apoptose88
  - 5.2.3.2. LncARN et télomères88
  - 5.2.3.3. LncARN et stabilité du génome89
  - 5.2.3.4. LncARN et cellules souches cancéreuses89
  - 5.2.4. Les circuits de motilité cellulaire89
  - 5.3. Les IncARN comme outils de diagnostic, pronostic et cibles thérapeutiques91
  - 5.3.1. Diagnostic et pronostic91
  - 5.3.2. Cibles thérapeutiques91
  - Conclusion - Perspectives 95
  - Glossaire 97
  - Liste des acronymes 103
  - Bibliographie 115
  - Index 151
Origine de la notice:
- OCoLC ;
- ZWZ ;
- Electre