Hace más de 40.000 años, las poblaciones de cazadores-colectores utilizando la piedra para sus herramientas se instalan en Guinea Ecuatorial en las provincias continentales de Centro Sur, Kie-Ntem, Litoral y Wele-Nzas. Algunos descubrimientos de piedras talladas en las islas de Bioko, Corisco y Elobey sugieren que también se asentaron allí más tarde. A falta de investigaciones en Guinea Ecuatorial, los trabajos realizados en Camerún y en Gabón sugieren que los aldeanos se instalan en las provincias continentales a partir de - 3000 años, en primer lugar en la provincia del Litoral. Estas antiguas aldeas deben estar vinculadas a la expansión de locutores bantúes desde Camerún hacia Sudáfrica. Dichos aldeanos tuvieron que mudarse rápidamente a la isla de Bioko. A partir de esta época, su modo de vida se convierte lentamente predominante dejando en todas partes cerámicas características, con una segunda fase de difusión del trabajo de hierro a partir de -2.600 años.

Desde hace unos 2.000 años se sigue la evolución de las culturas materiales en las Islas de Corisco y Bioko, las únicas que han conocido investigaciones arqueológicas para esas épocas. También en Coriseo, así como en el Rio Muni, se han descubierto vestigios que permiten por la arqueología histórica pasar al estudio de las nuevas interrelaciones entre Europa y el Golfo de Guinea iniciadas hace poco más de 500 años.