Dans Société d'Anthropologie de Paris
par Gourjon, Géraud ; Degioanni, Anna
Bulletins et mémoires de la société d’anthropologie de Paris
Résultat de OpenEdition : Journals
AdFiT v1.7 (Admixture Files Tool): input files creating tool for population genetic admixture estimation software
- Éditeur(s)
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Date
- 2010-06-09T02:00:00Z
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Notes
- Les logiciels d’estimation du mélange génétique entre populations les plus utilisés dans la littérature scientifique au cours de ces vingt dernières années sont : ADMIX, ADMIX95, Mistura, Admix 2.0, LEA et LEADMIX. Chacun de ces logiciels nécessite un fichier d’entrée avec un format et une extension spécifiques. Nous présentons ici un outil d’aide dans le processus de création des fichiers d’entrée : AdFiT (Admixture Files Tool), version 1.7, un logiciel multilingue (anglais, français et espagnol). à partir d’un fichier commun de données, il permet de créer instantanément les fichiers d’entrée pour ces 6 logiciels, ainsi que pour deux autres, Parallel LEA (ParLEA) et Mixtur. L’utilisation de plusieurs logiciels et de tous les marqueurs génétiques disponibles est nécessaire pour estimer efficacement les taux de mélange. Cela exige la création de fichiers d’entrée multiples, avec le format propre à chaque logiciel et conduit à une grande manipulation de données, augmentant les risques d’erreurs de saisie. AdFit permet de faire tout cela rapidement, facilement et sans erreur. AdFiT est disponible gratuitement en ligne pour une utilisation non commerciale.
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Langues
- Français
- Sujet(s)
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Droits
- info:eu-repo/semantics/openAccess .
- https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
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