Biologie végétale
Nutrition et métabolisme
3e édition
Jean-François Morot-Gaudry
Christophe Maurel
François Moreau
Roger Prat
Hervé Sentenac
Dunod
Remerciements
IX
Introduction
1
Chapitre 1 La plante et l'eau5
1. L'eau dans la cellule végétale5
1.1 Plasmolyse et turgescence6
1.2 L'eau, élément nécessaire à la vie7
1.3 Les caractéristiques physico-chimiques de la molécule d'eau8
1.4 La compartimentation cellulaire et l'eau8
1.5 Apoplasme et symplasme10
2. Transport de l'eau et continuum sol/plante/atmosphère11
2.1 Les plantes terrestres absorbent l'eau à partir du sol11
2.2 Les plantes absorbent l'eau par les racines11
2.3 L'eau est transportée des racines aux feuilles par les vaisseaux du xylème13
2.4 Transport radial de l'eau au niveau des feuilles14
2.5 Consommation d'eau par les plantes15
3. Bases physiques du transport de l'eau16
3.1 Les potentiels hydriques Ψ16
3.2 Gradients de potentiel hydrique et forces motrices des flux d'eau19
3.3 Relations flux-force : notion de conductance21
4. Aquaporine22
5. Transpiration et stomates23
6. Adaptation des plantes aux milieux secs25
7. Eau et productivité26
L'essentiel
27
Exercices28
Solutions29
Chapitre 2 Nutrition minérale30
1. Comment définir la nutrition minérale ?30
2. Ions nutritifs et fonctions31
2.1 Eléments essentiels, macro- et micro-éléments31
2.2 Rôle des principaux éléments essentiels33
2.3 Interactions entre éléments minéraux et nutrition minérale35
2.4 Effet de la disponibilité des ressources minérales sur la croissance36
3. Voies de transport des ions minéraux37
3.1 Tissus vasculaires et voies symplastiques et apoplastiques37
3.2 Transport radial dans la racine38
3.3 Transport axial vers les parties aériennes39
4. Transport passif, transport actif et différents types de systèmes de transport39
4.1 Critères thermodynamiques de classification des systèmes de transport40
4.2 Critères mécanistiques de classification des systèmes de transport47
4.3 Aperçu général des différents modes de transport des ions dans les membranes plasmique et vacuolaire48
5. Cinétiques des transports : le formalisme michaélien51
5.1 Affinité du transport51
5.2 Sélectivité du transport53
6. Exemples de systèmes de transport ionique53
6.1 Canaux potassiques « Shaker » de la membrane plasmique54
6.2 Système de transport du nitrate57
6.3 Transport du fer dans la racine59
7. Symbioses racinaires et nutrition minérale61
7.1 Endomycorhize et ectomycorhize61
7.2 Symbioses fixatrices d'azote63
7.3 Interactions symbiotiques avec les bactéries PGPR de la rhizosphère65
7.4 Mécanismes moléculaires impliqués dans l'établissement des symbioses fixatrices d'azote et des symbioses mycorhiziennes65
8. Développement racinaire et nutrition minérale66
9. Aspects agronomiques et environnementaux66
L'essentiel
69
Exercices70
Solutions71
Chapitre 3 Photosynthèse : mise en évidence73
1. Autotrophie et hétérotrophie73
2. Localisation de la photosynthèse75
3. Mise en évidence de la photosynthèse77
3.1 Production d'02 à la lumière en présence de CO277
3.2 Mesure des échanges gazeux (O2 ou CO2) photosynthétiques78
3.3 Expériences de Van Niel79
3.4 Assimilation du carbone du CO2 : synthèse de glucides80
3.5 Expériences de Hill81
3.6 Réactions d'oxydoréduction et énergétique de la photosynthèse81
4. Les pigments photosynthétiques et l'absorption de la lumière83
4.1 Spectre d'absorption84
4.2 Les chlorophylles et leurs propriétés85
4.3 Les caroténoïdes et leurs propriétés88
4.4 Comment se comportent les chlorophylles vis-à-vis de la lumière ?89
4.5 Spectres d'action de la photosynthèse91
4.6 Courbe de réponse de la photosynthèse à l'éclairement92
5. Les différentes phases de la photosynthèse94
L'essentiel
96
Exercices97
Solutions98
Chapitre 4 Machinerie photosynthétique et énergétique99
1. Qu'est-ce qu'un photosystème ?100
1.1 Organisation et principe de fonctionnement d'un photosystème100
1.2 Les deux types de photosystèmes102
2. Structure et fonctionnement du photosystème II10
2.1 L'antenne104
2.2 Le centre réactionnel104
2.3 L'oxydation de l'eau105
3. Structure et fonctionnement du photosystème I107
4. Chaîne de transfert des électrons108
4.1 Le complexe b6f et les transporteurs mobiles (quinones, plastocyanine)109
4.2 Le transfert acyclique des électrons (« schéma en Z »)109
4.3 Le transfert cyclique des électrons112
5. Synthèse de l'ATP dans le chloroplaste113
5.1 La théorie chimio-osmotique113
5.2 Expérience « du bain acide » (Jagendorf et Uribe, 1966)114
5.3 La translocation des protons par la chaîne photosynthétique115
5.4 Origine et mécanisme de translocation des protons dans le thylacoïde116
5.5 Le gradient de protons ou force proton-motrice118
5.6 L'ATP synthase : structure et fonctionnement119
5.7 Bilan de la photophosphorylation (rapport ATP/2e-)123
L'essentiel
125
Exercices126
Solutions127
Chapitre 5 Photosynthèse : aspects métaboliques129
1. Mise en évidence des premiers composés formés par la photosynthèse130
2. Cycle de réduction des pentoses ou cycle de Calvin131
2.1 Fixation du 14CO2133
2.2 Réduction de l'acide 3-phosphoglycérique en trioses-phospates133
2.3 La régénération du RuBP134
2.4 Bilan du cycle de Calvin136
3. La photorespiration137
3.1 L'effet oxygène137
3.2 La voie du glycolate139
3.3 Importance quantitative et qualitative de la photorespiration142
3.4 Signification de la photorespiration143
4. Structure et régulation de la rubisco144
4.1 Structure de la rubisco144
4.2 Activation de la rubisco144
4.3 Synthèse des sous-unités de la rubisco146
4.4 Régulation du cycle de Calvin146
5. Différents types de photosynthèse148
5.1 Mise en évidence du métabolisme C4149
5.2 Régulation de la PEP carboxylase par phosphorylation/déphosphorylation153
5.3 Comportement photosynthétique des plantes C3 et C4153
5.4 Plantes à métabolisme CAM156
6. Effets globaux, circulation du carbone planétaire158
6.1 Teneur en CO2 de l'atmosphère et cycle biogéochimique158
L'essentiel
162
Exercices163
Solutions164
Chapitre 6 Devenir des photo-assimilats166
1. Devenir des trioses-phosphates166
2. Synthèse du saccharose et de l'amidon168
2.1 Synthèse du saccharose168
2.2 Voie de synthèse de l'amidon170
3. Synthèse des acides gras171
4. Assimilation de l'azote et du soufre173
4.1 Assimilation du nitrate174
4.2 Assimilation de l'ammonium175
4.3 Assimilation du soufre dans les feuilles176
5. Transport à longue distance des assimilats178
5.1 Le système conducteur phloémien et la sève élaborée178
5.2 Le moteur du chargement et du transport phloémien179
5.3 Le transport à longue distance de la sève élaborée182
5.4 Déchargement du phloème183
L'essentiel
184
Exercices185
Solutions186
Chapitre 7 Le catabolisme chez les plantes187
1. Catabolisme des glucides188
1.1 Génération des hexoses-phosphates190
1.2 Voie de la glycolyse190
1.3 Voie d'oxydation des pentoses-phosphates193
2. Respiration mitochondriale195
2.1 Métabolisme du pyruvate et du malate dans la mitochondrie196
2.2 Le cycle de Krebs196
2.3 La chaîne respiratoire199
2.4 La synthèse d'ATP dans la mitochondrie201
2.5 Bilan en ATP de l'oxydation complète du glucose204
2.6 La régulation de la respiration mitochondriale205
2.7 Les différents types de respiration : considérations physiologiques207
3. Catabolisme des lipides et des acides aminés208
3.1 Catabolismes des acides gras208
3.2 Oxydation des acides aminés210
3.3 Le quotient respiratoire210
4. Fermentation des végétaux210
L'essentiel
214
Exercices215
Solutions216
Chapitre 8 Métabolisme secondaire : quelques aspects218
1. Synthèse dans la cellule végétale218
2. Composés isopréniques ou isoprénoïdes220
2.1 Terpènes221
2.2 Terpènes en C40 : les caroténoïdes222
2.3 Terpènes en C30 : les stérols222
3. Phénylpropanoïdes223
3.1 Les acides phénoliques224
3.2 Les flavonoïdes224
3.3 Les lignines225
4. Hétérosides et alcaloïdes227
4.1 Les hétérosides227
4.2 Les alcaloïdes228
5. Conclusions228
L'essentiel
230
Exercices231
Solutions232
Glossaire
233
Bibliographie
237
Index
238