Les maladies infectieuses émergentes : état de la situation et perspectives
Sommaire7
Mandat9
Composition du groupe de travail11
Groupe plénier11
Sous-groupes thématiques12
Personnalités auditionnées13
Synthèse - État des lieux15
Approche descriptive16
Facteurs et situations d'émergence16
Indicateurs et modalités de surveillance17
Contribution des sciences humaines et sociales19
Recommandations21
Mettre l'accent sur une stratégie audacieuse de recherche et de formation pour une aide plus efficace à la gestion des situations d'émergence de maladies infectieuses21
- Recommandations prioritaires : un principe, une organisation innovante21
¤ Un principe : l'approche interdisciplinaire21
¤ Une organisation innovante21
- Recommandations détaillées - Développer la recherche et la formation sur les maladies infectieuses émergentes22
¤ Vers une recherche intégrative, favorisant l'innovation22
¤ Des formations hybrides23
Dans le cadre de recommandations existantes sur la veille et l'action, les propositions et suggestions suivantes mériteraient d'être développées24
- Optimiser la surveillance et assurer son évolution24
- Se préparer à l'action24
Préambule27
Avant-propos27
Avertissements - Limites au rapport29
- Délimitation du cadre du rapport29
- Contexte de rédaction du rapport limité dans le temps et coïncidant avec la pandémie de grippe A/H1N1v29
- Champs du sujet non ou incomplètement développés à cette étape30
Introduction générale31
Première partie :
Données descriptives de quelques maladies infectieuses émergentes récentes
Introduction35
Historique et contexte37
Quelques maladies infectieuses émergentes récentes39
Le SRAS42
- Histoire naturelle, cycle de vie et brève description de la maladie42
- Epidémiologie et chronologie de l'émergence42
- Facteurs favorisant l'émergence43
- Mesures prises, retour d'expérience et surveillance43
¤ Evaluation du risque43
¤ Mesures de gestion mises en place43
- Résultats et analyse critique43
¤ Prévisibilité d'une ré-émergence de cette infection44
L'infection à virus West Nile44
- Histoire naturelle, cycle de vie et brève description de la maladie44
- Epidémiologie et chronologie de l'émergence44
¤ Cas des Etats-Unis (Marfin et al., 2001)44
¤ Cas de l'Europe (autre que la France)45
¤ Cas de la France45
- Facteurs favorisant l'émergence45
- Mesures prises, retour d'expérience et surveillance46
¤ Evaluation du risque46
¤ Mesures de gestion mises en place46
- Résultats et analyse critique46
¤ Prévisibilité de l'implantation de l'infection sur le territoire national47
L'infection à virus Chikungunya47
- Histoire naturelle, cycle de vie et brève description de la maladie47
- Epidémiologie et chronologie de l'émergence47
- Facteurs favorisant l'émergence49
- Mesures prises, retour d'expérience et surveillance49
¤ Evaluation du risque49
¤ Mesures de gestion mises en place49
- Résultats et analyse critique49
¤ Prévisibilité de l'infection50
Les entérocoques résistant aux glycopeptides (ERG)50
- Histoire naturelle, cycle de vie et brève description de la maladie50
- Epidémiologie et chronologie de l'émergence51
- Facteurs favorisant l'émergence52
- Mesures prises, retour d'expérience et surveillance52
¤ Mesures de gestion mises en place52
- Résultats et analyse critique53
Données descriptives générales et outils de diagnostic54
Prévisibilité des émergences en fonction des paramètres environnementaux et climatiques56
Deuxième partie : Facteurs biologiques et situations d'émergence de nouvelles maladies infectieuses
Introduction59
Déterminants et facteurs principaux d'émergence/ré-émergence60
Données générales61
- Agent et vecteur61
¤ Évolution et adaptation des micro-organismes61
¤ Adaptation des vecteurs61
- Hôte61
¤ Augmentation de la susceptibilité de l'hôte61
¤ Changements des comportements et des habitudes de vie des populations humaines61
- Environnement62
¤ Changements de l'environnement physique62
¤ Facteurs liés à l'environnement socio-économique62
¤ Facteurs liés à l'environnement organisationnel62
Pourquoi des agents infectieux émergent ou ré-émergent ?62
Pouvons-nous extrapoler ces connaissances et prédire les causes possibles à de nouvelles émergences infectieuses ?65
Refonder l'inférence causale dans les recherches sur les MIE67
Dynamique du vivant, diversité biologique et maladies infectieuses émergentes69
L'origine des agents infectieux humains69
Comment expliquer la genèse des micro-organismes pathogènes de l'humain ?70
Est-il possible d'estimer la richesse spécifique en agents infectieux potentiellement émergents, et cela a-t-il un sens ?73
Recherches actuelles sur les notions de virulence/avirulence, virulence/transmissibilité, virulence/ persistance dans l'environnement74
Rôle fonctionnel de la diversité biologique et équilibres multi-dynamiques dans les écosystèmes75
Evolution, force motrice de l'émergence76
Généralités sur l'adaptation et la sélection76
Evolution à court terme de la sélection versus évolution à long terme81
Notions de virulence, d'adaptation ou de maladaptation locales et de « trade-off »82
Conclusion82
Troisième partie : Indicateurs et modalités de surveillance
Avant-propos85
Définition et champs d'action85
Définition85
Scenarii d'émergence86
Des indicateurs : pour quoi faire, pour qui ?86
Objectifs88
Propositions d'indicateurs88
Indicateurs selon les milieux à surveiller88
- Surveillance des humains dans la population générale88
- Surveillance des soignants et du milieu de soins89
- Surveillance d'autres populations spécifiques90
- Surveillance des vecteurs réellement ou possiblement impliqués dans les mécanismes de transmission90
- Surveillance des réservoirs animaux en élevage industriel, des animaux domestiques, et sauvages, ainsi que des filières de l'alimentation animale90
- Surveillance de l'environnement91
- Surveillance des changements de comportements socio-économiques et culturels91
Indicateurs selon les sources d'information (ou « capteurs » des signaux)91
- Capteurs en rapport avec les humains91
- Capteurs en rapport avec le monde animal et les vecteurs92
- Capteurs en rapport avec l'environnement92
Analyses et tableaux de bord pour décideurs92
- Analyse de risque92
- Analyses de scenarii et d'évaluation des mesures préconisées92
- Définir des niveaux d'alerte et organiser la réponse92
- Conforter les décideurs sur le contenu et les éléments de l'expertise93
- Evaluation « continue »93
Réseaux de veille et de surveillance aux niveaux européen et international95
Limites ou contraintes des dispositifs envisagés96
Conclusion98
Tableaux d'indicateurs99
Quatrième partie : Contribution des sciences humaines et sociales à la connaissance, à la prévention et à la réponse aux MIE
Introduction105
Mise en place d'une politique de prévention primaire de l'infection à VIH en France107
Anthropologie sociale et culturelle et lutte contre les épidémies de fièvre Ebola et Marburg110
La clinique de la terreur : aporie des équipes de réponse aux épidémies de fièvres hémorragiques virales (FHV)110
Le rôle de l'anthropologue111
Réponse, coercitive et/ou compréhensive, à une épidémie112
Anthropo-épidémiologie : réservoir de virus, épizootie et épidémie113
SRAS114
Chronologie de l'émergence114
Facteurs favorisant l'émergence114
- Facteurs anthropologiques114
- Sociologie de la globalisation114
- Sociologie des rumeurs115
Gouvernance et mesures de gestion de la crise115
- Chine : faiblesse du ministère de la Santé et autoritarisme tronqué115
- Quarantaines115
- Quarantaines et régimes politiques : le paradigme d'Ackerknecht116
- Psychosociologie des quarantaines116
- Restrictions de déplacement116
- Une nouvelles gouvernance de la santé internationale ?117
Résultats et analyse critique117
- Evaluation des méthodes non pharmaceutiques de lutte contre la transmission117
- Analyses de l'impact économique117
- Le spectre de la pandémie118
Contribution des sciences sociales à l'analyse des pandémies de grippe118
H1N1 1918-1919118
H5N1 1997118
A/H1N1 2009120
Stratégies profanes de prévention du risque d'infection à virus A/H1N1 2009 en population générale120
La réaction des Français au risque d'infection à virus A/H1N1 2009121
Qui a accepté de se faire vacciner et pourquoi ?122
Le rôle de l'éthique dans l'acceptabilité des mesures de santé publique123
Émergence des problèmes de santé publique sous l'angle de la science politique124
Le caractère contingent de l'émergence et de la prise en compte des problèmes de santé publique125
Conditions sociopolitiques nécessaires à l'émergence et à la reconnaissance des problèmes de santé publique126
Les enjeux liés aux « luttes définitionnelles »127
Comment les profanes perçoivent les risques infectieux129
Le paradigme psychométrique129
L'analyse culturaliste des risques130
Représentations sociales du risque131
De la « résistance » à la notion d'« acceptabilité » (vaccinale)131
Histoire132
De la résistance à l'acceptabilité132
L'acceptabilité ou l'impératif de comprendre les pratiques132
L'acceptabilité ou la révolution de l'information et de la communication133
Emergence et acceptabilité : la pandémie grippale de 2009 et la campagne de vaccination133
Cinquième partie : Propositions
Propositions générales135
Propositions spécifiques137
Propositions spécifiques concernant les facteurs et situations d'émergence137
Propositions spécifiques concernant la surveillance138
Proposition spécifiques concernant la contribution des SHS139
Références bibliographiques141
Rapports154
Principaux sites Web à consulter155
Glossaire157
Annexes
Annexe I - Avis relatif aux risques pour la santé liés aux effets qualitatifs du changement climatique159
Annexe II - Caractérisation de la connaissance sur les risques environnementaux simples et complexes, et méthodologie d'évaluation du risque et de sa gestion167
Annexe III - Organisation des vigilances relatives aux produits de santé171
Annexe IV - Surveillance européenne des maladies transmissibles et émergentes174
Annexe V - Prise en compte du thème maladies infectieuses émergentes dans le cadre du programme Santé-environnement et Santé-travail 2005-2007175
Annexe VI - SRAS : chronologie d'une pandémie (novembre 2002 - septembre 2003)186
Annexe VII - Bilan et réflexions sur la recherche en situation d'urgence - Exemple du programme de recherche A/H1N1 2009197
Encarts, figures et tableaux
Encart 1 Schéma causal de l'écologie des maladies infectieuses émergentes71
Encart 2 Facteurs d'émergence de bactéries résistantes, un exemple d'approche complexe et intégrée76
Encart 3 Exemple d'élargissement d'un dispositif de surveillance autour des Samu Centre 1594
Encart 4 Exemples de limites liées à quelques-unes des sources et « capteur » proposés97
Figure 1 Schématisation du principe d'équilibres dynamiques multiples (illustrés par des flèches) associant un agent étiologique infectieux, un hôte susceptible et un environnement favorable60
Figure 2 Phylogénie des bactéries Bordetellae66
Figure 3 Comparaison des risques d'introduction journalière du virus West Nile67
Figure 4 Diagramme « causal » expliquant l'émergence du virus Hendra chez l'homme69
Figure 5 Phylogénies comparées hôtes-pathogènes73
Figure 6 Principes de l'analyse et de la réponse aux signaux d'alerte issus de la veille sanitaire87
Tableau 1 Liste de quelques nouveaux agents responsables de maladies récentes chez l'humain, identifiés de 1976 à 200540
Tableau 2 Classification des déterminants principaux responsables de l'émergence, dans les populations humaines, de 177 agents étiologiques responsables de maladies infectieuses émergentes, et présentation de quelques exemples de pathologies associées64
Tableau 3 Délai entre introduction des antibiotiques aux Etats-Unis d'Amérique et apparition des premières résistances acquises78
Tableau 4 Exemples de résistances bactériennes émergentes80
Tableaux d'indicateurs
Objectif : Anticipation99
Objectif : Détection (champ humain exclusivement)101
Figures dans Annexe II
Caractérisation de la connaissance sur les risques environnementaux simples et complexes et méthodologie d'évaluation du risque et de sa gestion167
Acceptable, tolerable and intolerable risks (Traffic light model)
169
Schéma d'organisation des vigilances Afssaps173