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La génomique en biologie végétale

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Résumé

Présente les méthodes et des concepts de la génomique en biologie végétale, allant des grands programmes internationaux de séquençages aux indispensables outils de la bio-informatique, en passant par les méthodes d'analyse de l'expression des gènes incluant leurs produits métaboliques finaux et leur spécificité tissulaire et/ou cellulaire.


  • Contributeur(s)
  • Éditeur(s)
  • Date
    • 2004
  • Notes
    • Glossaire. Index
  • Langues
    • Français
  • Description matérielle
    • 582 p. : ill. ; 24 x 16 cm
  • Collections
  • Sujet(s)
  • ISBN
    • 2-7380-1167-5
  • Indice
    • 582 Physiologie et écologie végétale
  • Quatrième de couverture
    • Aujourd'hui les différents champs relevant de la génomique transforment en profondeur les recherches conduites en biologie végétale... et au-delà, dans les domaines de l'écophysiologie et de l'amélioration des plantes. Cet ouvrage expose un très large éventail de ces méthodes et concepts nouveaux, des grands programmes internationaux de séquençage aux indispensables outils de la bio-informatique, en passant par les analyses de l'expression des gènes (transcriptome, protéome) qui prennent en compte leurs produits métaboliques finaux (métabolome) et leur spécificité tissulaire et / ou cellulaire (imagerie).

      Il permet ainsi de comprendre l'intégration, au sein de la plante, des grandes fonctions physiologiques (photosynthèse, nutrition minérale, etc.) et des programmes de développement (germination, floraison, fructification, etc.).

      Dans les domaines de la génétique et de l'amélioration des plantes, l'ouvrage rend compte des apports de la génomique pour l'utilisation des marqueurs moléculaires, l'analyse de la variabilité génétique et l'étude des caractères quantitatifs. Dans les domaines de l'écophysiologie et de l'agronomie il ouvre de nouvelles perspectives, comme la modélisation des peuplements ; en matière de biotechnologie, il décrit les interactions entre la programmation génétique et les lois physico-chimiques lors de la mise en place des biopolymères, véritables constituants des structures végétales.

      Enfin, d'un point de vue juridique, il cherche à expliciter les enjeux de la protection comme de la diffusion des résultats de la génomique.

      Élaboré par des chercheurs de l'INRA, du CNRS, du CIRAD et des Universités comme un outil de référence, exhaustif et synthétique, cet ouvrage s'adresse aux étudiants de fin d'études universitaires ou agronomiques, aux professeurs de l'enseignement supérieur, aux techniciens, ingénieurs et scientifiques qui souhaitent aborder rapidement la génomique végétale et se former aux changements majeurs en cours dans les approches de la biologie.


  • Tables des matières
      • La génomique en biologie végétale

      • J.-F. Morot-Gaudry/J.-F. Briat

      • Institut National de la Recherche Agronomique

      • Préface
      • M. Caboche 7
      • Avant-propos
      • M. Lefort 9
      • Introduction
      • J.-F. Briat et J.-F. Morot-Gaudry11
      • Génomique structurale et analyse in silico
      • 1. Structure physique du génome nucléaire des plantes15
      • M. Delseny, M. Echeverria et E. Lasserre
      • 2. Le séquençage de génomes de plantes33
      • N. Choisne, N. Demange, G. Orjeda, L. Michelet, E. Pelletier, M. Salanoubat, J. Weissenbach et F. Quétier
      • 3. Génomique et bio-informatique : introduction59
      • H. Chapiello et F. Rodolphe
      • 4. Banques et bases de données en biologie61
      • H. Chiapello
      • 5. Prédiction de gènes77
      • P. Nicolas et H. Chapiello
      • 6. Stratégies permettant d'assigner une fonction in silico aux séquences protéiques issues de projets de génomique91
      • J.-F. Gibrat et A. Marin
      • 7. Les comparaisons massives de séquences protéiques115
      • J.-L. Risler, A. Louis, S. Mohseni-Zadeh, P. Brezellec et Y. Diaz-Lazcoz
      • Génomique fonctionnelle : de la séquence à la fonction in planta
      • 8. Les collections de mutants et la génétique inverse133
      • F. Granier et D. Bouchez
      • 9. Analyse du transcriptome végétal par les puces à ADN155
      • P. Doumas, C. Rothan et S. Robin
      • 10. La protéomique et ses applications à la biologie végétale183
      • M. Zivy, J. Joyard et M. Rossignol
      • 11. L'apport de la microscopie et de l'imagerie en génomique209
      • S. Brown, C. Poujol-Talbot, J. Kronenberger, J. Traas et B. Satiat-Jeunemaitre
      • 12. Métabolome237
      • A. Krapp, L. Kerhoas, A. Hénaut, J. Einhorn et J.-F. Morot-Gaudry
      • 13. Mesures de flux métaboliques265
      • M. Dieuaide-Noubhani, A.-P. Alonso, C. Roby, et P. Raymond
      • Les plantes modèles de la génomique végétale
      • 14. L'espèce modèle Arabidopsis thaliana289
      • D. Bouchez
      • 15. Le riz : une plante modèle pour la génomique végétale303
      • M. Delseny
      • 16. Medicago truncatula, plante modèle pour les légumineuses et les interactions plantes-microorganismes311
      • E.-P. Journet
      • 17. La tomate, espèce modèle pour la génomique des Solanacées et pour l'ensemble des fruits charnus327
      • C. Etienne, M. Bouzayen, M. Causse et C. Rothan
      • Génomique, variabilité génétique et amélioration des plantes
      • 18. Les marqueurs moléculaires349
      • M. Falque et S. Santoni
      • 19. Éléments transposables et analyse de la biodiversité végétale377
      • C. Mhiri et M.-A. Grandbastien
      • 20. Génomique, caractérisation de gènes majeurs et de QTL403
      • V. Lefebvre, A. Bendahmane et M. Causse
      • 21. Dissection génétique d'un caractère complexe chez Arabidopsis : lignées recombinantes et recherche de QTL427
      • O. Loudet et F. Daniel-Vedele
      • 22. Évolution moléculaire et validation de gènes candidats437
      • D. Manicacci et A. Charcosset
      • 23. Le maïs et le blé, céréales modèles pour la recherche en biologie intégrative et son application à la sélection453
      • B. Hirel, J. Le Gouis, P. Perez, M. Falque, F. Quétier, A. Murigneux, P. Rogowsky et A. Charcosset
      • Réflexions sur la génomique
      • 24. Combiner génomique et modélisation pour l'analyse de la tolérance aux contraintes environnementales475
      • F. Tardieu
      • 25. De la génomique à l'auto-organisation493
      • P. Colonna, V. Planchot, M. Axelos, Y. Popineau
      • 26. Protection et diffusion des résultats de génomique et biotechnologies végétales : quels enjeux pour la recherche publique ?515
      • B. Teyssendier de la Serve et M. Trommetter
      • Glossaire
      • C. Meyer et J.-F. Morot-Gaudry 535
      • Index 549
      • Liste des auteurs 579

  • Origine de la notice:
    • Electre
  • Disponible - 582 GEN

    Niveau 2 - Sciences